More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0943 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0943  50S ribosomal protein L14  100 
 
 		 122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00200525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3318  50S ribosomal protein L14  100 
 
 		 122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000362831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1076  50S ribosomal protein L14  94.26 
 
 		 122 aa  231  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0690  50S ribosomal protein L14  92.62 
 
 		 122 aa  229  7.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1356  50S ribosomal protein L14  91.8 
 
 		 122 aa  229  8.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0481946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0636  50S ribosomal protein L14  88.52 
 
 		 122 aa  221  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143899  hitchhiker  0.0000000109372 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0711  50S ribosomal protein L14  81.15 
 
 		 122 aa  207  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121544  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  201  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3995  ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  200  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219417  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2764  ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000816669  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  197  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2847  50S ribosomal protein L14  86.89 
 
 		 122 aa  197  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.169441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0343  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  196  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1936  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1943  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2028  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479722  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1364  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0203367 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2055  ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000741427  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1342  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0385141  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1966  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  193  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00306344  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1223  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  193  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  193  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1186  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  193  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.367223  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2191  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  193  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  193  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2208  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0996  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  191  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1668  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  191  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0136083  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1440  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  191  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4594  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0570  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  190  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2305  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  189  8e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0162624  normal  0.103415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3174  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  189  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0264  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  189  9e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188398  normal  0.453731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1918  50S ribosomal protein L14  78.15 
 
 		 119 aa  189  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.320617  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0769  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  189  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234537  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0295  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  189  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  189  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1555  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  189  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  189  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  189  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1374  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  188  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.439933  normal  0.532331 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0601  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  187  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1850  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  187  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  187  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  187  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5060  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  187  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.750337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2154  50S ribosomal protein L14  78.15 
 
 		 119 aa  187  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.776638 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2469  50S ribosomal protein L14  78.15 
 
 		 119 aa  187  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.315328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  73.77 
 
 		 122 aa  186  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3438  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  186  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  185  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0329  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.5842e-28  unclonable  0.0000000445572 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3657  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2362  ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.956656  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0415  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000011877  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1343  50S ribosomal protein MRPL14P  74.8 
 
 		 123 aa  184  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2314  50S ribosomal protein L14P  72.95 
 
 		 122 aa  184  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109714  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2746  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  183  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.014298  normal  0.185382 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0235  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  183  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  183  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03161  50S ribosomal protein L14  72.36 
 
 		 123 aa  183  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000022346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0403  ribosomal protein L14  72.36 
 
 		 123 aa  183  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3904  50S ribosomal protein L14  73.17 
 
 		 123 aa  183  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000392566  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03112  hypothetical protein  72.36 
 
 		 123 aa  183  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000201498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3605  50S ribosomal protein L14  72.36 
 
 		 123 aa  183  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000364384  normal  0.0248646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3504  50S ribosomal protein L14  72.36 
 
 		 123 aa  183  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000579404  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3793  50S ribosomal protein L14  72.36 
 
 		 123 aa  183  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000402045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0403  50S ribosomal protein L14  72.36 
 
 		 123 aa  183  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000132736  hitchhiker  0.0000717726 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4633  50S ribosomal protein L14  72.36 
 
 		 123 aa  183  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000683604  normal  0.378647 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0293  50S ribosomal protein L14  73.17 
 
 		 123 aa  183  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000113985  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0593  50S ribosomal protein L14  73.17 
 
 		 123 aa  183  8e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000194944  normal  0.41091 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3695  50S ribosomal protein L14  72.36 
 
 		 123 aa  183  8e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000688942  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2897  ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  183  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3699  50S ribosomal protein L14  72.36 
 
 		 123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000119434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3899  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00304511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3991  50S ribosomal protein L14  72.36 
 
 		 123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000125728  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0676  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448087  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3741  50S ribosomal protein L14  72.36 
 
 		 123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000040815  hitchhiker  0.0036093 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0289  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111281  hitchhiker  0.00000195891 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0333  50S ribosomal protein L14  71.54 
 
 		 123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000092381  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0708  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000253605  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0070  50S ribosomal protein L14  73.17 
 
 		 123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000146326  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3734  50S ribosomal protein L14  72.36 
 
 		 123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000182354  normal  0.0166061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3626  50S ribosomal protein L14  72.36 
 
 		 123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00182904  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08950  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.459474  normal  0.0351235 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3328  ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000964027  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0415  50S ribosomal protein L14  71.54 
 
 		 123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0110237  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3812  50S ribosomal protein L14  72.36 
 
 		 123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000039471  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3797  50S ribosomal protein L14  72.36 
 
 		 123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3626  50S ribosomal protein L14  72.36 
 
 		 123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000411381  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0636  ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000379152  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0766  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115755  normal  0.0767388 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4538  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.118021 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2164  50S ribosomal protein L14  72.36 
 
 		 123 aa  182  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000108066  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5069  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000172755  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00948  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000686211  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0497  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000305715  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0494  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0424686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0729  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0102983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>