More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0940 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  100 
 
 		 140 aa  287  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  100 
 
 		 140 aa  287  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  89.29 
 
 		 140 aa  264  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  86.43 
 
 		 140 aa  254  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  84.89 
 
 		 140 aa  253  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  84.17 
 
 		 140 aa  250  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  82.14 
 
 		 140 aa  248  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  73.57 
 
 		 141 aa  215  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  73.88 
 
 		 137 aa  208  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  68.61 
 
 		 138 aa  207  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  70.9 
 
 		 139 aa  205  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  67.63 
 
 		 144 aa  204  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  67.63 
 
 		 144 aa  204  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 144 aa  203  8e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  67.36 
 
 		 144 aa  202  9e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 144 aa  202  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  65.22 
 
 		 142 aa  201  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 142 aa  202  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  65.97 
 
 		 145 aa  201  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  63.77 
 
 		 144 aa  201  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  66.19 
 
 		 141 aa  200  6e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  67.65 
 
 		 139 aa  199  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  70.15 
 
 		 158 aa  198  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1868  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 141 aa  197  3e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0066  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 141 aa  198  3e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0038879  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1697  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 141 aa  197  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000686182  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2074  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 141 aa  197  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0136024  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  67.65 
 
 		 139 aa  197  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1918  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 138 aa  197  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.573905 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  67.65 
 
 		 139 aa  197  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16711  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  65.47 
 
 		 139 aa  197  5e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 139 aa  196  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 		 144 aa  196  7e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 139 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  65 
 
 		 143 aa  195  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  67.91 
 
 		 145 aa  195  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  65 
 
 		 144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  64.75 
 
 		 140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  67.65 
 
 		 139 aa  194  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 144 aa  194  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 144 aa  194  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 144 aa  194  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 144 aa  194  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 144 aa  194  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 144 aa  194  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 144 aa  194  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 144 aa  194  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 144 aa  194  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  63.57 
 
 		 145 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1122  50S ribosomal protein L16  64.34 
 
 		 161 aa  193  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  62.32 
 
 		 144 aa  193  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  63.57 
 
 		 147 aa  193  6e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19961  50S ribosomal protein L16  64.34 
 
 		 161 aa  193  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.64825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17331  50S ribosomal protein L16  64.08 
 
 		 160 aa  193  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.613797  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1643  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 160 aa  193  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1962  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 		 158 aa  192  9e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0369  50S ribosomal protein L16  67.39 
 
 		 158 aa  192  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1939  50S ribosomal protein L16  65.44 
 
 		 138 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17581  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 160 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2025  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 138 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.755365  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  65 
 
 		 139 aa  192  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1940  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 138 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17421  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 160 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 139 aa  192  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 		 139 aa  191  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1961  ribosomal protein L16  65.47 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.564853  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  62.14 
 
 		 145 aa  191  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 151 aa  190  6e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  60.71 
 
 		 140 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1860  50S ribosomal protein L16  62.59 
 
 		 141 aa  188  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0761083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2270  50S ribosomal protein L16  62.04 
 
 		 144 aa  187  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000763654  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2311  50S ribosomal protein L16  62.04 
 
 		 144 aa  187  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1026  50S ribosomal protein L16  64.03 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00185253  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 		 137 aa  187  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  60.43 
 
 		 143 aa  186  7e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  62.04 
 
 		 144 aa  185  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0283  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 138 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000045602  normal  0.0248702 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0412  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 138 aa  186  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000749036  normal  0.231316 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1770  50S ribosomal protein L16  64.03 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000306557  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0722  ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0274  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 138 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000119561  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  62.04 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0293  50S ribosomal protein L16  65.47 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0021896  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0041  50S ribosomal protein L16  62.59 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.123597  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3310  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 138 aa  184  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000336027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3454  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 138 aa  184  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000581922  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2752  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 138 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000962733  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0355  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 138 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000176857  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0334  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 138 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000896805  normal  0.0198335 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0726  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 137 aa  184  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00162053  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0256  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 138 aa  183  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00173139  normal  0.0172892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0321  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 138 aa  184  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000904365  decreased coverage  0.00244098 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0504  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 138 aa  183  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.000000000243822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>