More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0929 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0929  30S ribosomal protein S7  100 
 
 
156 aa  317  5e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.50114e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3332  30S ribosomal protein S7  99.36 
 
 
156 aa  315  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52337e-15 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  90.38 
 
 
156 aa  290  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  3.27115e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2861  30S ribosomal protein S7  87.18 
 
 
156 aa  286  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0179023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0622  30S ribosomal protein S7  85.9 
 
 
156 aa  281  3e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.78965e-06  decreased coverage  1.81754e-21 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 
156 aa  263  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  6.56375e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  79.49 
 
 
156 aa  258  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 
156 aa  234  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 
156 aa  233  7e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 
156 aa  231  4e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 
156 aa  231  4e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 
156 aa  230  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  217  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  215  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  215  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  214  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  6.10678e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0319  ribosomal protein S7  66.03 
 
 
156 aa  214  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  2.98761e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  213  9e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3439  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  213  9e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000192356  decreased coverage  2.49886e-05 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2328  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  213  9e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  1.57389e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  213  1e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  213  1e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0493  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  212  2e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00259026  hitchhiker  4.89129e-08 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  211  2e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  212  2e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  3.85897e-05 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0323  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  212  2e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0311  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  211  3e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00398327  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  211  3e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  2.87313e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  210  6e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  3.45641e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  210  7e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0180  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  210  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  5.36383e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  209  8e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  209  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  209  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  209  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  209  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  4.91637e-05  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  209  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  209  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.77948e-07  unclonable  8.38241e-06 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  209  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4466  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  209  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  208  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0166  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  208  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.61088e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0196  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00224175  hitchhiker  0.00012084 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0192  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  208  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4060  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00273725  hitchhiker  1.07053e-06 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0195  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  208  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0242327  hitchhiker  2.00344e-07 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0144  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  208  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.70326e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  209  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0227  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  207  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0190  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  207  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  decreased coverage  0.000349844 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  207  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  8.92295e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  207  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  1.47883e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  208  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5077  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  207  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0195  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  207  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0296111  hitchhiker  5.62021e-06 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  207  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.43156e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  207  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  207  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  207  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.92136e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3763  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  207  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  6.73821e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  207  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  207  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  207  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
155 aa  206  7e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4280  30S ribosomal protein S7  62.42 
 
 
157 aa  206  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  7.00691e-05  unclonable  2.87747e-12 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  206  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.39374e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  206  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.54226e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  206  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  206  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.53509e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  206  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.19716e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  63.06 
 
 
157 aa  206  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.12886e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  206  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.71364e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  206  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.01536e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  206  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  59.62 
 
 
156 aa  205  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.49814e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3805  ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  205  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59243  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  205  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  205  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  4.42376e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  60.51 
 
 
157 aa  205  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4321  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  205  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  unclonable  9.75416e-11 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2694  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  205  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.298478 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  204  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  9.00899e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  204  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0683  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  204  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  204  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.84124e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  204  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4008  ribosomal protein S7  58.64 
 
 
162 aa  204  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0613135  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10697  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  204  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.786123 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17220  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  203  6e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4694  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  203  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127766  unclonable  3.19623e-08 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  60.38 
 
 
159 aa  203  6e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  203  7e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  4.45482e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  203  7e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.70955e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  203  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  7.22737e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0754  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  203  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.259118 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0236  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  203  8e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.12284e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  203  8e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>