More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0902 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  61.14 
 
 		 561 aa  721    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  58.65 
 
 		 561 aa  696    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  64.71 
 
 		 561 aa  762    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  96.43 
 
 		 560 aa  1090    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  100 
 
 		 560 aa  1132    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  47.6 
 
 		 563 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  39.21 
 
 		 565 aa  435  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.61 
 
 		 561 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  36.89 
 
 		 568 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  36.94 
 
 		 599 aa  401  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.14 
 
 		 558 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.31 
 
 		 592 aa  398  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.4 
 
 		 559 aa  397  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.25 
 
 		 559 aa  395  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  37.93 
 
 		 559 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  36.62 
 
 		 582 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  37.17 
 
 		 581 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.22 
 
 		 584 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  37.52 
 
 		 581 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.97 
 
 		 559 aa  381  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.14 
 
 		 559 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  37.1 
 
 		 557 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  36.89 
 
 		 560 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.65 
 
 		 554 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.25 
 
 		 558 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.65 
 
 		 559 aa  364  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  35.66 
 
 		 558 aa  365  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  37.35 
 
 		 582 aa  361  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  33.7 
 
 		 564 aa  360  3e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  34.76 
 
 		 557 aa  360  5e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  34.84 
 
 		 591 aa  356  5.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  36.47 
 
 		 562 aa  355  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  32.62 
 
 		 558 aa  355  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  35.61 
 
 		 547 aa  352  1e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  32.62 
 
 		 558 aa  351  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  35.95 
 
 		 582 aa  349  8e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  33.87 
 
 		 558 aa  347  4e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.15 
 
 		 555 aa  342  7e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  37.84 
 
 		 556 aa  336  7e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  37.45 
 
 		 552 aa  335  9e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  32.6 
 
 		 556 aa  335  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.04 
 
 		 573 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  37.5 
 
 		 560 aa  326  8.000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  34 
 
 		 552 aa  325  2e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  30.13 
 
 		 558 aa  323  4e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  32.07 
 
 		 537 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  32.25 
 
 		 537 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  34.49 
 
 		 543 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  34.31 
 
 		 556 aa  320  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  34.31 
 
 		 543 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  34.71 
 
 		 565 aa  319  7.999999999999999e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  34.71 
 
 		 565 aa  319  7.999999999999999e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  35.35 
 
 		 557 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  34.06 
 
 		 544 aa  315  9e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  33.27 
 
 		 555 aa  316  9e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  37.67 
 
 		 558 aa  312  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  37.63 
 
 		 544 aa  310  5e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  33.33 
 
 		 544 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  36.77 
 
 		 557 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  32.63 
 
 		 549 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  36.58 
 
 		 557 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  34.71 
 
 		 549 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.42 
 
 		 549 aa  300  4e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  31.9 
 
 		 551 aa  299  9e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.86 
 
 		 557 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02769  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.48 
 
 		 557 aa  296  8e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368527  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  31.71 
 
 		 549 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.2 
 
 		 530 aa  295  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.73 
 
 		 551 aa  293  5e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  31.06 
 
 		 549 aa  293  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  30.88 
 
 		 549 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.96 
 
 		 553 aa  291  3e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.41 
 
 		 547 aa  291  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.26 
 
 		 546 aa  289  9e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  33.4 
 
 		 559 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  34.81 
 
 		 582 aa  288  1e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  30.12 
 
 		 571 aa  289  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0321  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.77 
 
 		 546 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.06 
 
 		 547 aa  287  4e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  30.31 
 
 		 547 aa  286  5.999999999999999e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  33.2 
 
 		 560 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.32 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.63 
 
 		 527 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  35.29 
 
 		 549 aa  283  7.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  35.29 
 
 		 549 aa  283  7.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  30.04 
 
 		 547 aa  282  9e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  30.93 
 
 		 563 aa  282  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  32.41 
 
 		 561 aa  280  5e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1129  hypothetical protein  31.78 
 
 		 586 aa  280  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3375  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.69 
 
 		 549 aa  279  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0385  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.11 
 
 		 534 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2799  hypothetical protein  32.58 
 
 		 546 aa  278  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2998  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.7 
 
 		 543 aa  278  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3204  ubiquinone biosynthesis protein AarF  33.21 
 
 		 549 aa  277  5e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  32.81 
 
 		 550 aa  276  8e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  32.47 
 
 		 542 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1190  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.93 
 
 		 552 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.601295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0250  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.3 
 
 		 543 aa  275  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2430  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.4 
 
 		 544 aa  274  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3897  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.4 
 
 		 549 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>