More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0833 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  100 
 
 
267 aa  544  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  93.26 
 
 
267 aa  506  1e-142  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  59.63 
 
 
280 aa  314  1e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  53.38 
 
 
269 aa  273  2e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  54.68 
 
 
267 aa  265  6e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  46.86 
 
 
271 aa  239  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  48.52 
 
 
278 aa  220  2e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  38.2 
 
 
268 aa  174  1e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.63598e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3856  methyltransferase type 11  44.06 
 
 
264 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3874  Methyltransferase type 11  41.44 
 
 
262 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  38.02 
 
 
291 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  35.77 
 
 
290 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3790  Methyltransferase type 11  41.06 
 
 
262 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3733  methyltransferase type 11  41.44 
 
 
262 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387697  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  35.59 
 
 
309 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  33.45 
 
 
309 aa  140  2e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  35.5 
 
 
292 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  35.11 
 
 
292 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  8.94072e-06 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  35.88 
 
 
269 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  35.23 
 
 
295 aa  134  1e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  36.02 
 
 
291 aa  134  1e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  34.07 
 
 
291 aa  133  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  35.25 
 
 
269 aa  131  1e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  33.85 
 
 
266 aa  130  2e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  32.74 
 
 
307 aa  128  9e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  34.1 
 
 
275 aa  127  2e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  30 
 
 
281 aa  125  7e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  30 
 
 
281 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  35.93 
 
 
272 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  31.03 
 
 
284 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  30.92 
 
 
284 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  35.5 
 
 
272 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  35.06 
 
 
267 aa  118  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  33.85 
 
 
306 aa  118  1e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  34.23 
 
 
268 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  32.18 
 
 
262 aa  115  9e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  36.36 
 
 
276 aa  115  1e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  33.58 
 
 
274 aa  114  1e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  30.88 
 
 
295 aa  114  2e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  35.98 
 
 
272 aa  114  2e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  33.21 
 
 
255 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  30.51 
 
 
295 aa  113  4e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  33.21 
 
 
274 aa  111  1e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  33.33 
 
 
558 aa  110  2e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  29.86 
 
 
283 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  28.63 
 
 
268 aa  108  7e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  27.55 
 
 
315 aa  108  7e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  31.4 
 
 
268 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  26.24 
 
 
269 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  25.86 
 
 
269 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  26.62 
 
 
269 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  26.62 
 
 
269 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  26.62 
 
 
269 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  26.62 
 
 
269 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  26.62 
 
 
269 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  31.62 
 
 
297 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  26.24 
 
 
269 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  25.86 
 
 
269 aa  102  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  26.59 
 
 
279 aa  102  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  30.3 
 
 
312 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  32.37 
 
 
294 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  25.28 
 
 
285 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  28.98 
 
 
319 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 
320 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  32.31 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  28.87 
 
 
338 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  32.6 
 
 
294 aa  95.5  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  29.74 
 
 
265 aa  95.5  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  28.63 
 
 
253 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  30.98 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  29.77 
 
 
253 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  6.3017e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  24.25 
 
 
269 aa  92.8  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  29.46 
 
 
333 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1049  Methyltransferase type 11  31.66 
 
 
252 aa  89.4  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.027968  normal  0.205367 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  27.44 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  30 
 
 
272 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  30.4 
 
 
338 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2067  biotin biosynthesis protein BioC  29.09 
 
 
263 aa  86.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  31.42 
 
 
367 aa  85.1  1e-15  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  36.68 
 
 
320 aa  85.1  1e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 
313 aa  84  2e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2836  biotin biosynthesis protein BioC  26.88 
 
 
260 aa  84  3e-15  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  28.68 
 
 
267 aa  82.8  5e-15  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  28.68 
 
 
267 aa  82.4  6e-15  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  29.3 
 
 
321 aa  82.4  6e-15  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  28.68 
 
 
267 aa  82.4  6e-15  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 
313 aa  82.8  6e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  29.04 
 
 
321 aa  81.6  1e-14  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  22.31 
 
 
253 aa  82  1e-14  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  30.45 
 
 
304 aa  80.9  2e-14  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  28.73 
 
 
321 aa  80.5  3e-14  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  28.68 
 
 
321 aa  80.1  3e-14  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  28.73 
 
 
321 aa  80.5  3e-14  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  28.63 
 
 
251 aa  79.7  4e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  28.3 
 
 
251 aa  80.1  4e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.89171e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  27.86 
 
 
251 aa  79.3  6e-14  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  8.03036e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  42.57 
 
 
200 aa  78.6  1e-13  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  30.55 
 
 
338 aa  78.6  1e-13  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>