More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0832 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
266 aa  547  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  93.31 
 
 
270 aa  513  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  60.59 
 
 
271 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  51.32 
 
 
272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  45.11 
 
 
273 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  42.48 
 
 
275 aa  208  6e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1663  alpha/beta hydrolase fold  39.54 
 
 
271 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  40.31 
 
 
270 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3873  alpha/beta hydrolase fold protein  44.74 
 
 
271 aa  168  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.627652  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3789  alpha/beta hydrolase fold  45.11 
 
 
271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3732  Alpha/beta hydrolase fold-1  44.87 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.093145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  32.33 
 
 
266 aa  141  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4025  bioH protein  31.84 
 
 
246 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3858  biotin biosynthesis protein (BioH)  31.84 
 
 
246 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3872  biotin biosynthesis protein (BioH)  31.84 
 
 
246 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4338  biotin biosynthesis protein BioH  31.84 
 
 
246 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4140  putative bioH protein  31.84 
 
 
246 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3948  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 
246 aa  131  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 
269 aa  131  9e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4250  putative bioH protein  31.71 
 
 
246 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4186  bioH protein, putative  30.2 
 
 
246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4227  putative bioH protein  28.98 
 
 
246 aa  125  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1010  putative bioH protein  28.98 
 
 
246 aa  125  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 
273 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  30.12 
 
 
263 aa  122  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2815  carboxylesterase  30.98 
 
 
238 aa  123  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  32.57 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  31.66 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  30.69 
 
 
272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 
273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 
338 aa  118  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  33.57 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  33.07 
 
 
254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  28.78 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  32.35 
 
 
322 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
286 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 
266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  32.86 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0023  pimeloyl-CoA synthesis (biotin biosynthesis)  32.13 
 
 
258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00488591  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  32.12 
 
 
266 aa  112  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  32 
 
 
273 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
276 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
274 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
272 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  31.66 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
277 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
272 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 
340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  29.15 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  28.91 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  27.7 
 
 
276 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 
328 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 
274 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 
273 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 
281 aa  108  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
324 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 
271 aa  108  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
272 aa  108  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
343 aa  108  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
273 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
278 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  30.65 
 
 
256 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
273 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
273 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
273 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  27.68 
 
 
278 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  28.01 
 
 
277 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  31.3 
 
 
266 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 
273 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  27.31 
 
 
278 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  27.31 
 
 
278 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
265 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  27.31 
 
 
278 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  27.31 
 
 
278 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 
273 aa  106  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
274 aa  106  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 
324 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  30 
 
 
258 aa  105  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  30 
 
 
258 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  27.31 
 
 
278 aa  105  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  30 
 
 
258 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
272 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 
273 aa  105  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  29.84 
 
 
255 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  30 
 
 
273 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  30.26 
 
 
273 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
278 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  30.83 
 
 
269 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 
330 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  28.12 
 
 
264 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  29.85 
 
 
278 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 
305 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
273 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  28.31 
 
 
273 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  29.57 
 
 
255 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
294 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>