154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0816 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  100 
 
 		 173 aa  342  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  90.75 
 
 		 173 aa  310  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  45.99 
 
 		 179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  44.9 
 
 		 183 aa  127  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5499  putative outer membrane protein  46.92 
 
 		 191 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  decreased coverage  0.000160663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2005  outer membrane protein-like protein  46.72 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779308  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  43.06 
 
 		 194 aa  124  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  46.04 
 
 		 214 aa  123  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  43.48 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  39.73 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  41.01 
 
 		 216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  37.86 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  39.04 
 
 		 179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  37.86 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5231  hypothetical protein  37.22 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  38.1 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  34.91 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  39.29 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  36.24 
 
 		 207 aa  101  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1728  outer membrane protein  43.07 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000467772 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  34.1 
 
 		 176 aa  99  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5562  hypothetical protein  37.21 
 
 		 175 aa  98.6  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.425424  normal  0.0185018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  37.85 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  40.96 
 
 		 166 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3132  hypothetical protein  37.8 
 
 		 173 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7119  hypothetical protein  39.71 
 
 		 177 aa  95.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  0.116456 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0511  outer membrane protein-like protein  34.76 
 
 		 172 aa  94.7  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  39.38 
 
 		 166 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3241  hypothetical protein  39.76 
 
 		 166 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  37.5 
 
 		 190 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  30.94 
 
 		 208 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  36.76 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3401  hypothetical protein  31.84 
 
 		 190 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380854  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  33.58 
 
 		 189 aa  90.1  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  36.26 
 
 		 174 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3371  outer membrane protein-like protein  33.81 
 
 		 195 aa  89.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.435295  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2390  hypothetical protein  33.73 
 
 		 182 aa  89  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  36.36 
 
 		 204 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  36.36 
 
 		 204 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1713  outer membrane protein  37.5 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7395  hypothetical protein  34.56 
 
 		 175 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967548  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6652  hypothetical protein  33.82 
 
 		 175 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2255  hypothetical protein  34.31 
 
 		 186 aa  84.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  36.36 
 
 		 204 aa  84.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  35.66 
 
 		 203 aa  84.3  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7733  hypothetical protein  30.34 
 
 		 216 aa  84  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1504  hypothetical protein  29.33 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  32.35 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2979  hypothetical protein  34.78 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  29.93 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1324  hypothetical protein  30.82 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3624  hypothetical protein  32.04 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3212  hypothetical protein  29.93 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.617159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  34.27 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5023  hypothetical protein  31.06 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0763629 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3731  hypothetical protein  30.15 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.352743  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  34.27 
 
 		 203 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1970  hypothetical protein  31.25 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1369  hypothetical protein  31.25 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75101  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0990  hypothetical protein  31.25 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1277  hypothetical protein  31.25 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3019  hypothetical protein  31.25 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2252  hypothetical protein  31.25 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2536  outer membrane protein  26.79 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  29.45 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5210  hypothetical protein  30.06 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000680106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5193  hypothetical protein  32.85 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3148  hypothetical protein  30.56 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456613  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3550  outer membrane protein  33.85 
 
 		 204 aa  73.9  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00012513  normal  0.0785876 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0882  hypothetical protein  34.78 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7435  outer membrane protein-like protein  24.84 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.938816 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5299  hypothetical protein  32.21 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0560052  normal  0.052078 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4652  hypothetical protein  32.12 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5115  hypothetical protein  32.12 
 
 		 181 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.85355  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0040  hypothetical protein  31.72 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  30.22 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5975  hypothetical protein  31.25 
 
 		 208 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0059  hypothetical protein  30.71 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5617  hypothetical protein  28.48 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19111 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0896  hypothetical protein  32.05 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1215  hypothetical protein  30.71 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1498  hypothetical protein  30.71 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0070  hypothetical protein  30.71 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0071  hypothetical protein  30.71 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  26.83 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1565  hypothetical protein  30.71 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4132  hypothetical protein  30.5 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2744  outer membrane protein  27.03 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0930  hypothetical protein  33.91 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.642874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0933  hypothetical protein  33.91 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.085058  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0087  hypothetical protein  30.71 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0900  hypothetical protein  34.06 
 
 		 322 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319174  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  28.17 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3987  hypothetical protein  30.71 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4380  hypothetical protein  30.71 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116285  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3523  hypothetical protein  26.24 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0851  hypothetical protein  31.39 
 
 		 302 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.307036  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0936  hypothetical protein  29.55 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.588545  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0122  hypothetical protein  29.29 
 
 		 301 aa  64.7  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3193  hypothetical protein  28.92 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>