More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0812 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 291 aa  598  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  98.63 
 
 		 291 aa  592  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  58.16 
 
 		 289 aa  346  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  54.12 
 
 		 289 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  55.8 
 
 		 287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  43.51 
 
 		 455 aa  226  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  40.53 
 
 		 412 aa  214  9e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  41.76 
 
 		 408 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  37.59 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  35.29 
 
 		 351 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  38.75 
 
 		 279 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  35.21 
 
 		 425 aa  185  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  35.23 
 
 		 407 aa  183  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  36.56 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  36.76 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  35.16 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  36.09 
 
 		 378 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  31.94 
 
 		 284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  31.72 
 
 		 280 aa  162  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  29.74 
 
 		 284 aa  158  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1361  putative signal transduction protein  33.94 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.758377  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  33.57 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  35.08 
 
 		 369 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  35.56 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  29.7 
 
 		 284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  37.3 
 
 		 415 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  29.81 
 
 		 284 aa  149  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  34.52 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  32.73 
 
 		 517 aa  146  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  30.34 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  29.67 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  32.76 
 
 		 397 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  27.92 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  31.38 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  30.29 
 
 		 283 aa  132  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  30.71 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  29.36 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  29.37 
 
 		 287 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 		 280 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  32.08 
 
 		 358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  33.78 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  31.44 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  28.8 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  28.35 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  29.07 
 
 		 290 aa  125  7e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  26.14 
 
 		 297 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  32.62 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  28.75 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  28.97 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  27.34 
 
 		 284 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  26.61 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  26.14 
 
 		 303 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  34.43 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  29.78 
 
 		 281 aa  115  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  27.73 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  30.95 
 
 		 302 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  27.9 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 		 285 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  26.07 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  28.93 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  30.49 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  28.47 
 
 		 293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  29.96 
 
 		 505 aa  109  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  29.7 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  27.37 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.63 
 
 		 412 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  31.19 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  29.65 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  28.88 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  29.1 
 
 		 716 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  29.09 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  28.7 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  35.79 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  27.6 
 
 		 650 aa  102  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  29.58 
 
 		 718 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  28.35 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  27.4 
 
 		 287 aa  99  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  27.43 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  27.36 
 
 		 283 aa  97.4  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  31.19 
 
 		 258 aa  95.9  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  28.04 
 
 		 292 aa  95.9  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  30.5 
 
 		 544 aa  95.9  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  31.21 
 
 		 293 aa  95.5  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  28.36 
 
 		 304 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  28.45 
 
 		 287 aa  93.6  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  22.22 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  26.56 
 
 		 281 aa  92.8  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0691  signal transduction protein  30.54 
 
 		 388 aa  92.4  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.55 
 
 		 634 aa  91.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  25.59 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  30.94 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  25 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  26.96 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  28.38 
 
 		 427 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  26.96 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  28.93 
 
 		 509 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>