More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0802 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  92.24 
 
 		 336 aa  635    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 338 aa  691    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  71.9 
 
 		 339 aa  491  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  65.35 
 
 		 330 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  42.31 
 
 		 340 aa  257  3e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0201  glycosyl transferase family 2  46.41 
 
 		 334 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0212  glycosyl transferase family 2  46.41 
 
 		 334 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0210  glycosyl transferase family protein  47.01 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.640164  normal  0.0425626 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0190  glycosyl transferase family protein  46.71 
 
 		 334 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4485  glycosyl transferase family 2  42.47 
 
 		 336 aa  242  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0112223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  44.64 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.8 
 
 		 349 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  40.8 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2620  glycosyl transferase family 2  42.82 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  41.69 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0266  glycosyl transferase family protein  40.71 
 
 		 341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2182  glycosyl transferase family 2  39.13 
 
 		 356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  45.91 
 
 		 347 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  46.12 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  44.7 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 		 352 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  40.62 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 		 365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  34.44 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.55 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.71 
 
 		 341 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 		 364 aa  129  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 		 1250 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  37.33 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  38.39 
 
 		 306 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 		 280 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  36.92 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  38.19 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 		 321 aa  119  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  34.72 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  32.59 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 		 338 aa  116  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  36.62 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0695  glycosyl transferase family 2  32.19 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  34.1 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  36.97 
 
 		 663 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 		 334 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  40.93 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.89 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  38.43 
 
 		 364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  36.41 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 		 299 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  34.39 
 
 		 340 aa  105  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  35.98 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.71 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  32.06 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 		 376 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0628  glycosyl transferase family 2  36.62 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  27.43 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1923  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 273 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969327 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  30.87 
 
 		 330 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5383  glycosyl transferase family 2  34.26 
 
 		 304 aa  99.4  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 316 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.29 
 
 		 321 aa  96.3  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 		 330 aa  96.3  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08760  glycosyl transferase  37.5 
 
 		 296 aa  95.9  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0855056  normal  0.752756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20860  glycosyl transferase  35.98 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2728  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 1035 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  26.39 
 
 		 299 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 		 338 aa  94  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 		 597 aa  94  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 		 262 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 		 296 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.7 
 
 		 294 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 		 373 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 		 332 aa  93.2  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 		 278 aa  93.2  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 		 253 aa  92.8  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  30.26 
 
 		 294 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 235 aa  92.4  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  35.44 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 244 aa  91.3  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  32 
 
 		 1015 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 		 283 aa  90.9  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 		 354 aa  90.5  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2415  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 		 279 aa  89.7  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000015495  normal  0.849916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>