135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0723 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  100 
 
 		 332 aa  669    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  94.88 
 
 		 332 aa  629  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  75.39 
 
 		 320 aa  489  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  43.08 
 
 		 325 aa  256  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  39.45 
 
 		 324 aa  236  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  41.39 
 
 		 317 aa  236  6e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  40.73 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  40.06 
 
 		 325 aa  232  9e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  41.81 
 
 		 329 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.28 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  41.41 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  38.12 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  40.06 
 
 		 322 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  41.95 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  40.74 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  43.1 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  40.88 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  41.25 
 
 		 320 aa  223  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  43.29 
 
 		 323 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  42.71 
 
 		 329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  41.03 
 
 		 323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  42.07 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  41.55 
 
 		 322 aa  219  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  37.92 
 
 		 321 aa  219  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  41.1 
 
 		 323 aa  219  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  41.18 
 
 		 337 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  41.55 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  38.18 
 
 		 324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  38.23 
 
 		 313 aa  216  4e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  39.8 
 
 		 331 aa  215  8e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  38.6 
 
 		 323 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  38.3 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.3 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.3 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.3 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.3 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.3 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  39.02 
 
 		 341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  41.14 
 
 		 330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  39.01 
 
 		 319 aa  212  7e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  41.36 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  40.96 
 
 		 337 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  40.89 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  37.99 
 
 		 323 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  38.31 
 
 		 324 aa  209  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  40.55 
 
 		 321 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  40.55 
 
 		 321 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  40.55 
 
 		 321 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.34 
 
 		 327 aa  209  7e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  39.86 
 
 		 321 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  39.73 
 
 		 329 aa  206  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  41.01 
 
 		 298 aa  205  1e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  38.97 
 
 		 336 aa  205  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  40.57 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  39.06 
 
 		 322 aa  202  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  38.98 
 
 		 341 aa  202  7e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  39.06 
 
 		 322 aa  202  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  38.85 
 
 		 341 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  37.97 
 
 		 343 aa  196  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  39.59 
 
 		 328 aa  196  6e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  38.46 
 
 		 322 aa  196  6e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  35.33 
 
 		 584 aa  191  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  39.1 
 
 		 319 aa  190  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  37.29 
 
 		 344 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  42.92 
 
 		 270 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  32.73 
 
 		 329 aa  186  4e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  36.34 
 
 		 340 aa  183  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  35.49 
 
 		 347 aa  182  6e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  34.8 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  33.92 
 
 		 338 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  33.87 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  33.55 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  34.95 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  32.99 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  32.14 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  31.97 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  33.97 
 
 		 328 aa  159  9e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  33.45 
 
 		 334 aa  158  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  33.22 
 
 		 359 aa  155  9e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  31.44 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  30.89 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  30.98 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  30.53 
 
 		 344 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  30.03 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  31.01 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  32.05 
 
 		 640 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.15 
 
 		 352 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1117  hypothetical protein  28.33 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  29.55 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  27.63 
 
 		 320 aa  102  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  27.69 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1146  protein of unknown function DUF534  28.57 
 
 		 292 aa  99  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  26.64 
 
 		 384 aa  98.6  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3116  protein of unknown function DUF534  28.57 
 
 		 309 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0074  protein of unknown function DUF534  25.85 
 
 		 322 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0708  protein of unknown function DUF534  24.64 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1729  hypothetical protein  19.33 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0843802  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2904  hypothetical protein  26.12 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  25.26 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6747  hypothetical protein  25.29 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0509682 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>