More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0712 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0712  response regulator receiver modulated CheW protein  100 
 
 		 313 aa  636    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0724  response regulator receiver modulated CheW protein  97.12 
 
 		 313 aa  620  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.95273e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1284  putative CheW protein  67.64 
 
 		 314 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1583  response regulator receiver modulated CheW protein  65.05 
 
 		 316 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000416178  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2548  response regulator receiver modulated CheW protein  60.13 
 
 		 312 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000602434  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0879  chemotaxis protein CheV  60.59 
 
 		 312 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.877082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2739  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  59.67 
 
 		 312 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0066  response regulator receiver modulated CheW protein  46.2 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000119617  hitchhiker  0.00287896 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0508  putative CheW protein  41.61 
 
 		 326 aa  240  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3194  putative CheW protein  40.37 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1179  response regulator receiver modulated CheW protein  40.37 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3188  putative CheW protein  40.37 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3332  putative CheW protein  40.37 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4442  response regulator receiver modulated CheW protein  41.18 
 
 		 324 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  42.9 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1207  chemotaxis protein CheV  39.88 
 
 		 328 aa  233  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0176167  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2084  response regulator receiver modulated CheW protein  41.72 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.364681  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2798  putative CheW protein  39.75 
 
 		 326 aa  229  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0391  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  41.35 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1997  putative CheW protein  41.61 
 
 		 320 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.151796  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05890  hypothetical protein  38.84 
 
 		 326 aa  222  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000281  chemotaxis protein CheV  38.39 
 
 		 342 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.261322  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2021  response regulator receiver modulated CheW protein  41.03 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2905  putative CheW protein  39.87 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0197  response regulator receiver modulated CheW protein  39.34 
 
 		 346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3100  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  41.03 
 
 		 312 aa  209  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2843  response regulator receiver modulated CheW protein  40 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2308  putative CheW protein  39.68 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2939  response regulator receiver modulated CheW protein  40.19 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112041 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1493  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  39.87 
 
 		 318 aa  202  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000176679  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  37.17 
 
 		 311 aa  198  9e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  37.85 
 
 		 302 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000715462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  37.22 
 
 		 302 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  36.91 
 
 		 302 aa  192  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0147  response regulator receiver modulated CheW protein  38.92 
 
 		 321 aa  192  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  36.91 
 
 		 302 aa  192  9e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  36.59 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  36.59 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  36.59 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  36.28 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  36.28 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0196  response regulator receiver modulated CheW protein  38.61 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.031176  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2643  response regulator receiver modulated CheW protein  33.51 
 
 		 390 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1579  chemotaxis protein CheV  36.69 
 
 		 317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.184882  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0204  CheW domain protein  33.22 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000487468  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1656  ATP synthase gamma chain (ATP synthase F1 sector gammasubunit)  36.3 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.184709  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0330  chemotaxis protein CheV  34.84 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  37.46 
 
 		 301 aa  165  8e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0333  chemotaxis protein CheV  32.67 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3068  CheW protein  32.59 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.591629  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0311  chemotaxis protein CheV  32.67 
 
 		 318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1686  chemotaxis protein CheV  32 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.468174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2045  chemotaxis signal transduction protein, CheV-like  34.28 
 
 		 324 aa  159  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.85794e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1531  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  33.33 
 
 		 313 aa  155  7e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.577848  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1370  chemotaxis protein CheV  32.67 
 
 		 317 aa  155  8e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  34.35 
 
 		 320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  32.66 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  31.65 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  31.7 
 
 		 313 aa  149  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  32.67 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  32.67 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  35.41 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  34.45 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  32.42 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  32.6 
 
 		 310 aa  143  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  33.99 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  32.05 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  31.31 
 
 		 310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  32.89 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  33.66 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  31.44 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  31.53 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  31.06 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  31.89 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  33.11 
 
 		 309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  30.98 
 
 		 309 aa  136  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  33.11 
 
 		 309 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  33.44 
 
 		 306 aa  135  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  32.67 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  30.61 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  32.67 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  32.01 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  32.56 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  32.56 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  32.56 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  32.56 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  32.56 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  32.77 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  30.61 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  33 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  31.76 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  31.62 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  32.14 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  32.67 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3018  CheW protein  29.83 
 
 		 326 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  32.56 
 
 		 306 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  30.31 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  31.97 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  32.69 
 
 		 306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  32.24 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>