More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0682 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 333 aa  670    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  92.35 
 
 		 327 aa  614  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  55.45 
 
 		 362 aa  378  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  51.24 
 
 		 340 aa  341  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  50 
 
 		 358 aa  318  7e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  50 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  48.15 
 
 		 331 aa  272  6e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  40.43 
 
 		 357 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  40.83 
 
 		 356 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  36.92 
 
 		 334 aa  207  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  38.56 
 
 		 376 aa  203  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  38.62 
 
 		 336 aa  199  7e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  38.93 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  34.95 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  39.04 
 
 		 355 aa  192  5e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  34.58 
 
 		 337 aa  192  5e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  38.14 
 
 		 352 aa  192  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  38.6 
 
 		 332 aa  192  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  36.66 
 
 		 620 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  34.86 
 
 		 332 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  37.62 
 
 		 442 aa  189  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  36.17 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  38.01 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  36.21 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  36.75 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  36.66 
 
 		 440 aa  186  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  33.56 
 
 		 339 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  40 
 
 		 336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  37.28 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  37.01 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  35.33 
 
 		 349 aa  183  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  35.58 
 
 		 336 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  33.56 
 
 		 338 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  37.32 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  38.98 
 
 		 351 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  35.15 
 
 		 329 aa  182  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  37.62 
 
 		 337 aa  182  9.000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  32.27 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  32.24 
 
 		 351 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  35.24 
 
 		 333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  35.24 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  40 
 
 		 337 aa  179  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  36.05 
 
 		 338 aa  179  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  37.73 
 
 		 322 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  36.99 
 
 		 393 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  34.35 
 
 		 340 aa  178  9e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1231  aminodeoxychorismate lyase  37.97 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2728  aminodeoxychorismate lyase  37.29 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2634  aminodeoxychorismate lyase  37.29 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  33.43 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  35.22 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  39.08 
 
 		 328 aa  176  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  33.73 
 
 		 347 aa  176  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  34.62 
 
 		 344 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  38.06 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  36.79 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  37.16 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  32.83 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  35.27 
 
 		 325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  35.15 
 
 		 345 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  35.69 
 
 		 389 aa  172  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  32 
 
 		 337 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  34.29 
 
 		 362 aa  172  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  34.28 
 
 		 345 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  38.08 
 
 		 412 aa  172  7.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2153  hypothetical protein  35.05 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692536  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  37.67 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  36.27 
 
 		 403 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  34.53 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  35.15 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  37.75 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  36.61 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1861  hypothetical protein  37.46 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824281 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  36.3 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  36.08 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  35.37 
 
 		 342 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  37.37 
 
 		 349 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  36.11 
 
 		 579 aa  169  8e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  34.83 
 
 		 357 aa  169  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  36.43 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  34.81 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  32.82 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  35.46 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  35.71 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2282  putative lipoprotein  35.05 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1426  putative lipoprotein  35.05 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3387  putative lipoprotein  35.05 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2444  hypothetical protein  35.05 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  35.05 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  34.81 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2321  putative lipoprotein  35.05 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1190  putative lipoprotein  35.05 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  34.81 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1917  hypothetical protein  35.05 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  35.27 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  33.04 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  30.43 
 
 		 373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  37.06 
 
 		 362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  35.4 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  35.4 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>