228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0619 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 		 161 aa  316  7.999999999999999e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  98.76 
 
 		 161 aa  313  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  81.88 
 
 		 161 aa  264  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  80.62 
 
 		 161 aa  261  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  78.75 
 
 		 161 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  78.75 
 
 		 161 aa  249  9.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  76.25 
 
 		 161 aa  245  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  63.98 
 
 		 161 aa  210  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  59.12 
 
 		 163 aa  184  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  58.23 
 
 		 163 aa  183  8e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  58.23 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  58.23 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  58.23 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  58.23 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  58.23 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  58.23 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  58.23 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  56.88 
 
 		 161 aa  181  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  58.23 
 
 		 163 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  58.23 
 
 		 163 aa  180  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  56.25 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  58.86 
 
 		 163 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  52.2 
 
 		 164 aa  177  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  56.96 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  54.72 
 
 		 165 aa  175  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  55.97 
 
 		 164 aa  174  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  55.7 
 
 		 163 aa  173  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2479  putative nucleotide-binding protein  51.53 
 
 		 163 aa  169  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  48.75 
 
 		 161 aa  167  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  48.75 
 
 		 161 aa  167  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  53.75 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0558  putative nucleotide-binding protein  53.12 
 
 		 162 aa  160  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3058  putative nucleotide-binding protein  48.47 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309078 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  52.2 
 
 		 162 aa  153  9e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  49.38 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  47.5 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2291  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000470515  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1634  putative nucleotide-binding protein  48.47 
 
 		 163 aa  147  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0454282 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  48.17 
 
 		 163 aa  147  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0136  hypothetical protein  50.62 
 
 		 164 aa  147  8e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  48.12 
 
 		 165 aa  147  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  47.5 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  47.5 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2804  protein of unknown function DUF520  50.93 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000772661  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1191  putative nucleotide-binding protein  43.56 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.566237  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  46.25 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 		 160 aa  144  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3306  hypothetical protein  50.63 
 
 		 163 aa  144  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6653  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 		 163 aa  144  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59339  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  47.5 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  48.12 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1622  protein of unknown function DUF520  50 
 
 		 165 aa  142  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00216659  hitchhiker  0.0000000173634 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  46.25 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0865  putative nucleotide-binding protein  47.47 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  normal  0.0156848 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  45.62 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1379  putative nucleotide-binding protein  49.37 
 
 		 163 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.542697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0332  hypothetical protein  48.75 
 
 		 163 aa  140  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.408979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  46.25 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2778  putative nucleotide-binding protein  51.25 
 
 		 163 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00451374 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0409  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_002936  DET1318  putative nucleotide-binding protein  42.59 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  45.62 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1126  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  45.62 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0997  putative nucleotide-binding protein  45.62 
 
 		 163 aa  137  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1099  hypothetical protein  42.59 
 
 		 163 aa  137  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10576  putative nucleotide-binding protein  46.25 
 
 		 163 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.703775 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3073  putative nucleotide-binding protein  50.62 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760306  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4534  protein of unknown function DUF520  45.62 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.452055  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0690  nucleotide-binding protein  45.96 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4374  protein of unknown function DUF520  45.91 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0101  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  47.47 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57130  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4087  putative nucleotide-binding protein  46.88 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.568883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  46.88 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2001  putative nucleotide-binding protein  46.2 
 
 		 163 aa  134  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0477  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1607  protein of unknown function DUF520  43.64 
 
 		 165 aa  134  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.752652  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0112  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609186  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 		 161 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2278  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 		 162 aa  134  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0754  putative nucleotide-binding protein  46.88 
 
 		 161 aa  133  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1283  hypothetical protein  41.82 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17650  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.839683  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0095  putative nucleotide-binding protein  42.24 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.615818  normal  0.24721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1006  protein of unknown function DUF520  45.96 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3208  putative nucleotide-binding protein  46.25 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>