More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0611 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 208 aa  421  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  96.53 
 
 		 203 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  78.22 
 
 		 202 aa  331  4e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  79.9 
 
 		 210 aa  326  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  77.16 
 
 		 198 aa  318  3.9999999999999996e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  76.24 
 
 		 207 aa  293  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  72.08 
 
 		 206 aa  275  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  52.79 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  50.52 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  50.25 
 
 		 202 aa  207  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  49.75 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  51.31 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  49.48 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  46.53 
 
 		 205 aa  193  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  51.72 
 
 		 212 aa  184  8e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  51.72 
 
 		 200 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  43.52 
 
 		 195 aa  171  1e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  38.66 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  40.51 
 
 		 212 aa  151  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  42.55 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  38.14 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1952  DedA family protein  44.91 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  41.81 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  42.77 
 
 		 208 aa  143  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  41.97 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  42.44 
 
 		 207 aa  142  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  40 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  39.22 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  40.23 
 
 		 202 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  44.15 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  37.25 
 
 		 212 aa  141  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  39.78 
 
 		 218 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  39.78 
 
 		 218 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  39.78 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.95 
 
 		 203 aa  138  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2053  SNARE associated Golgi protein  40.72 
 
 		 216 aa  137  8.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  41.18 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.88 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  44.77 
 
 		 205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  37.5 
 
 		 205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  33.99 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  38.58 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  40.59 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  37.69 
 
 		 201 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  36.95 
 
 		 213 aa  131  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  38.42 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  40.24 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  34.72 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  36.57 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  34.13 
 
 		 208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  37.21 
 
 		 205 aa  128  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.41 
 
 		 206 aa  127  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.64 
 
 		 241 aa  127  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  38.5 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  40.7 
 
 		 199 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  37.57 
 
 		 325 aa  125  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  39.58 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.42 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4471  dedA family protein  36 
 
 		 201 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.238489 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0902  dedA family protein  36 
 
 		 201 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209208  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  34.34 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0722  SNARE associated Golgi protein  35.5 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.05 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  37.7 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  35 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  37.08 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  38.38 
 
 		 197 aa  122  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  40.61 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  37.85 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0773  DedA family protein  37.95 
 
 		 201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000448539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0708  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  37.95 
 
 		 201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0751539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0810  DedA family protein  37.95 
 
 		 201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.621407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0865  dedA family protein  37.95 
 
 		 201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  36.47 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0721  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  37.8 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.223536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0906  dedA family protein  37.8 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0759  SNARE associated Golgi protein  38.82 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.259781  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  34.38 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.46 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  33.68 
 
 		 200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  35.45 
 
 		 200 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  35.45 
 
 		 200 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  35.45 
 
 		 200 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  35.45 
 
 		 200 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  36.79 
 
 		 219 aa  114  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3271  dedA family protein  35.29 
 
 		 200 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  34.92 
 
 		 200 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  35.29 
 
 		 200 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0984  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.31 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  33 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  35.05 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  35.05 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  34.21 
 
 		 200 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0604  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.31 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00110976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  35.05 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  34.54 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  34.54 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  42 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  33.84 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>