More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0581 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  94.39 
 
 		 446 aa  859    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  100 
 
 		 446 aa  901    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  55.17 
 
 		 449 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  51.74 
 
 		 453 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  51.41 
 
 		 397 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  48.03 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  42.79 
 
 		 479 aa  351  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4086  putative ribonuclease BN  36.17 
 
 		 487 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3064  ribonuclease BN, putative  37.63 
 
 		 473 aa  257  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00183316  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1819  putative ribonuclease BN  35.44 
 
 		 442 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.193645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  36.48 
 
 		 450 aa  244  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  39.06 
 
 		 425 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  36.04 
 
 		 452 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2655  ribonuclease BN  36.53 
 
 		 439 aa  229  7e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2681  ribonuclease BN  36.77 
 
 		 561 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.267088 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3053  putative ribonuclease BN  35.84 
 
 		 451 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  34.09 
 
 		 447 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2958  ribonuclease BN  45.53 
 
 		 286 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0595  ribonuclease BN  34.22 
 
 		 460 aa  199  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0931  putative ribonuclease BN  30.15 
 
 		 459 aa  198  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  34.11 
 
 		 422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1514  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 472 aa  188  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.258349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2157  ribonuclease BN, putative  34.02 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  30.68 
 
 		 499 aa  183  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0958  ribonuclease BN, putative  28.35 
 
 		 411 aa  150  4e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.107096 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0739  putative ribonuclease BN  29.82 
 
 		 434 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0733  ribonuclease BN  29.85 
 
 		 439 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  29.34 
 
 		 439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0697  ribonuclease BN, putative  29.34 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47498  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  22.93 
 
 		 424 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  30.38 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  34.8 
 
 		 295 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  34.8 
 
 		 337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  34.8 
 
 		 337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  32.37 
 
 		 313 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  36.25 
 
 		 337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  31.44 
 
 		 451 aa  126  6e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  31.73 
 
 		 323 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  31.73 
 
 		 323 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  31.73 
 
 		 323 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  29.96 
 
 		 340 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0935  ribonuclease BN  26.36 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  31.33 
 
 		 323 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  31.73 
 
 		 298 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  29.2 
 
 		 336 aa  124  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  33.2 
 
 		 310 aa  124  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  29.64 
 
 		 297 aa  121  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1013  ribonuclease BN  27.6 
 
 		 427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.58276 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  31.33 
 
 		 285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0452  ribonuclease BN, putative  28.89 
 
 		 426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  35.32 
 
 		 294 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  29.27 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1471  ribonuclease BN  30.5 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.604096 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  28.74 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  29.76 
 
 		 314 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  30.97 
 
 		 290 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  30.97 
 
 		 290 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  30.97 
 
 		 290 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  30.97 
 
 		 290 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  30.97 
 
 		 290 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  29.43 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  29.07 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  28.39 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  28.74 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  27.37 
 
 		 525 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  27.37 
 
 		 525 aa  111  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0716  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  28.25 
 
 		 424 aa  111  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603481  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  26.11 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  26.11 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  26.11 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  26.11 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  28.96 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  33.58 
 
 		 445 aa  110  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  31.71 
 
 		 303 aa  109  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  25.93 
 
 		 437 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1623  ribonuclease BN  30.68 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722239  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  32.93 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  29.48 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  29.48 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  29.48 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  29.48 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  29.48 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  29.48 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  29.48 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  26.91 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  29.48 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  29.48 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  29.81 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  28.53 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  29.81 
 
 		 294 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  26.11 
 
 		 436 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  26.11 
 
 		 436 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  30.29 
 
 		 294 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  27.41 
 
 		 300 aa  107  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  30.19 
 
 		 292 aa  107  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  29.84 
 
 		 290 aa  106  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  26.56 
 
 		 433 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  25.28 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1765  YihY family protein  31.25 
 
 		 278 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0409  ribonuclease BN  31.25 
 
 		 278 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>