More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0574 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  100 
 
 		 193 aa  374  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  96.37 
 
 		 193 aa  363  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  69.79 
 
 		 195 aa  267  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  68.39 
 
 		 194 aa  250  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3020  membrane protein  69.83 
 
 		 194 aa  229  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  59.89 
 
 		 194 aa  214  7e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  59.04 
 
 		 198 aa  207  6e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  55.5 
 
 		 196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.11 
 
 		 200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3015  protein of unknown function DUF205  49.73 
 
 		 203 aa  151  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.400755  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1999  protein of unknown function DUF205  43.5 
 
 		 207 aa  148  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000645882  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  43.98 
 
 		 195 aa  148  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1111  hypothetical protein  45.83 
 
 		 212 aa  144  6e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  45.05 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  43.81 
 
 		 195 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  46.49 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.65 
 
 		 203 aa  141  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  47.96 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1223  protein of unknown function DUF205  46.15 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165062  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3624  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.08 
 
 		 198 aa  138  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000200164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3630  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.08 
 
 		 198 aa  138  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2329  hypothetical protein  44.56 
 
 		 197 aa  137  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0724  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.03 
 
 		 189 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2989  hypothetical protein  43.75 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0172  membrane protein  41.97 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1078  hypothetical protein  44.39 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  40 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.67 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07580  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.03 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0346741 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3399  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.03 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000706679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.5 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.5 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3665  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.03 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000835645  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0178  membrane protein  45.18 
 
 		 327 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.945445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0040  hypothetical protein  40.64 
 
 		 197 aa  135  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3712  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.5 
 
 		 198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00759588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3615  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.5 
 
 		 198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000137108 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1603  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.5 
 
 		 198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000195206 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4194  membrane protein  44.04 
 
 		 201 aa  134  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2695  hypothetical protein  43.23 
 
 		 224 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  39.27 
 
 		 200 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2521  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.92 
 
 		 203 aa  133  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635021 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.04 
 
 		 198 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.26 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4727  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.62 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  40 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2581  membrane protein  38.64 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0829  protein of unknown function DUF205  38.79 
 
 		 220 aa  131  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1592  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.61 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.827594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4637  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.92 
 
 		 192 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  40 
 
 		 198 aa  131  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.71 
 
 		 198 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1321  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  47.59 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1187  protein of unknown function DUF205  41.8 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000281015  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0104  membrane protein  40.1 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1944  membrane protein  42.42 
 
 		 242 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5145  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.86 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1811  hypothetical protein  41.88 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443893  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1594  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.52 
 
 		 212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4349  membrane protein  44.56 
 
 		 201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4024  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.86 
 
 		 192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0473  hypothetical protein  48.9 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537999  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2062  hypothetical protein  43.16 
 
 		 202 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  41.24 
 
 		 200 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3022  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.01 
 
 		 194 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5952  protein of unknown function DUF205  40.5 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0155  protein of unknown function DUF205  43.23 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.337449 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1757  protein of unknown function DUF205  43.01 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3380  membrane protein  42.27 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000102812  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0533  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.64 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0729  protein of unknown function DUF205  39.2 
 
 		 220 aa  125  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.382163  normal  0.327374 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2389  hypothetical protein  41.05 
 
 		 209 aa  125  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000658646  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  42.94 
 
 		 200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0526  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  45.74 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  40 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  43.43 
 
 		 219 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2009  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.2 
 
 		 196 aa  124  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401567 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  41.21 
 
 		 198 aa  124  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0384  hypothetical protein  46.35 
 
 		 209 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0813  membrane protein  39.89 
 
 		 200 aa  124  9e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.979835  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15131  membrane protein  41.27 
 
 		 197 aa  124  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2417  membrane protein  36.32 
 
 		 235 aa  124  9e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0125  hypothetical protein  43.46 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2025  membrane protein  35.68 
 
 		 234 aa  123  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0125  protein of unknown function DUF205  43.46 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.765264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  41.27 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3809  hypothetical protein  40.5 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2113  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.5 
 
 		 199 aa  122  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1382  hypothetical protein  42.93 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2175  membrane protein  36.32 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1323  hypothetical membrane spanning protein  42.93 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.143303  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0841  hypothetical protein  41.36 
 
 		 211 aa  122  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.058622  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2553  hypothetical protein  43.75 
 
 		 194 aa  122  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0541  hypothetical protein  42.86 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1072  hypothetical protein  42.47 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.205087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.86 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4413  hypothetical protein  42.64 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6612  protein of unknown function DUF205  44.69 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0697451 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1616  hypothetical protein  37.84 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>