More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0514 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 343 aa  689    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  48.68 
 
 		 357 aa  324  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  49.13 
 
 		 348 aa  310  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  46.94 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  46.96 
 
 		 349 aa  300  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  38.57 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  35.99 
 
 		 363 aa  195  7e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  37.28 
 
 		 336 aa  189  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  34.39 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  36.05 
 
 		 361 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 364 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  33.91 
 
 		 358 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  31.71 
 
 		 347 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 		 367 aa  145  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  30.91 
 
 		 345 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  32.35 
 
 		 349 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  31.8 
 
 		 345 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 327 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  26.92 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  34.23 
 
 		 353 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  27.67 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  27.67 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  27.67 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  36.18 
 
 		 398 aa  126  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  35.84 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  28.57 
 
 		 331 aa  122  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  28.48 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  32.46 
 
 		 444 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  31.58 
 
 		 374 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  31.75 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  29.74 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  37.61 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  31.45 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  29.7 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  30.36 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  34.12 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  31.47 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  31.21 
 
 		 373 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  30.52 
 
 		 378 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  26.84 
 
 		 395 aa  96.7  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  30.88 
 
 		 378 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  30.43 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  33.79 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  29.03 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  32.37 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  31.01 
 
 		 264 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3510  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  24.21 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  30.25 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  28.18 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  29.79 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  29.33 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  28.85 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  33.33 
 
 		 490 aa  73.2  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  28.48 
 
 		 278 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  26.4 
 
 		 492 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  28.52 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  30.77 
 
 		 565 aa  71.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  33.78 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  31.95 
 
 		 562 aa  71.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  31.97 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  27.54 
 
 		 483 aa  70.5  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  29.83 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  24.36 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  36 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  27.95 
 
 		 502 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  27.95 
 
 		 500 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  32.28 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  31.61 
 
 		 470 aa  68.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  25.91 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  29.3 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  29.75 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  31.79 
 
 		 254 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  30.19 
 
 		 478 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  28.66 
 
 		 255 aa  67  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  27.33 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  34.5 
 
 		 533 aa  67.4  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  30.99 
 
 		 549 aa  67  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  34.18 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  23.33 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  23.33 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  27.88 
 
 		 604 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  34.48 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  34.18 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  34.18 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  34.18 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  34.18 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  34.18 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  34.18 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  31.79 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  28.65 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  29.03 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  30.36 
 
 		 561 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  27.54 
 
 		 573 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  27.56 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  33.77 
 
 		 504 aa  64.3  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  27.68 
 
 		 493 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  29.17 
 
 		 567 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  28 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  29.45 
 
 		 588 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>