More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0485 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  59.46 
 
 		 662 aa  805    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  64.15 
 
 		 657 aa  864    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  71.84 
 
 		 657 aa  928    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  95.61 
 
 		 654 aa  1278    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  64.84 
 
 		 657 aa  880    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 		 660 aa  1341    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  59.82 
 
 		 657 aa  830    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  47.59 
 
 		 656 aa  614  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  45.71 
 
 		 586 aa  491  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  39.23 
 
 		 690 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  42.28 
 
 		 703 aa  433  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  38.62 
 
 		 708 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  38.86 
 
 		 671 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.57 
 
 		 654 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.5 
 
 		 710 aa  422  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  37.65 
 
 		 705 aa  413  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.27 
 
 		 675 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3765  peptidoglycan glycosyltransferase  40.33 
 
 		 675 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870412  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.42 
 
 		 675 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  42.33 
 
 		 582 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.92 
 
 		 645 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  38.53 
 
 		 675 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  35.29 
 
 		 729 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  41.4 
 
 		 631 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  36.07 
 
 		 713 aa  392  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  36.65 
 
 		 695 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.75 
 
 		 570 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.8 
 
 		 708 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.24 
 
 		 644 aa  389  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.68 
 
 		 582 aa  385  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  38.46 
 
 		 594 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  38.65 
 
 		 594 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  38.46 
 
 		 594 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  38.46 
 
 		 594 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  38.25 
 
 		 594 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  38.05 
 
 		 596 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  38.46 
 
 		 594 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  38.46 
 
 		 594 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.27 
 
 		 595 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  37.6 
 
 		 711 aa  381  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  37.56 
 
 		 682 aa  382  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.92 
 
 		 595 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.78 
 
 		 680 aa  373  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  38.85 
 
 		 607 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  38.52 
 
 		 583 aa  375  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  37.52 
 
 		 577 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  34.96 
 
 		 740 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.95 
 
 		 670 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  39.04 
 
 		 595 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  36.12 
 
 		 708 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  37.5 
 
 		 618 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  37.16 
 
 		 578 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  37.52 
 
 		 614 aa  368  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  38.62 
 
 		 615 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  36.93 
 
 		 578 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  37.23 
 
 		 577 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  38.42 
 
 		 615 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  38.67 
 
 		 615 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  38.42 
 
 		 615 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  39.04 
 
 		 600 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.63 
 
 		 582 aa  365  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  39.12 
 
 		 624 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  38.62 
 
 		 615 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.23 
 
 		 577 aa  364  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  38.67 
 
 		 615 aa  365  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  38.56 
 
 		 601 aa  364  3e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  37.23 
 
 		 632 aa  364  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  37.23 
 
 		 632 aa  364  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  37.23 
 
 		 632 aa  364  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  39.04 
 
 		 621 aa  364  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.86 
 
 		 621 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.61 
 
 		 704 aa  363  6e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  39.25 
 
 		 616 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  36.89 
 
 		 631 aa  362  8e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  36.84 
 
 		 630 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  36.84 
 
 		 630 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  36.31 
 
 		 644 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  33.1 
 
 		 719 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  38.73 
 
 		 605 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  38.39 
 
 		 587 aa  355  1e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  35.86 
 
 		 646 aa  355  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  38.24 
 
 		 548 aa  354  2.9999999999999997e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  37.95 
 
 		 577 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  37.63 
 
 		 614 aa  353  4e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  38.24 
 
 		 552 aa  353  4e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.35 
 
 		 582 aa  353  5e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.61 
 
 		 588 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  35.6 
 
 		 649 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  36.97 
 
 		 597 aa  353  5.9999999999999994e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  37.35 
 
 		 582 aa  353  7e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  36.9 
 
 		 581 aa  353  7e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  37.25 
 
 		 580 aa  352  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  37.08 
 
 		 582 aa  352  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  36.92 
 
 		 622 aa  352  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  37.81 
 
 		 614 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  37.81 
 
 		 614 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  37.81 
 
 		 614 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  37.81 
 
 		 614 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  37.81 
 
 		 614 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  37.81 
 
 		 614 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>