More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0464 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0932  uracil permease  80.15 
 
 		 416 aa  652    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.87035  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0481  uracil-xanthine permease  98.12 
 
 		 425 aa  823    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000026216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0464  uracil-xanthine permease  100 
 
 		 425 aa  833    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.774472  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0672  uracil-xanthine permease  68.3 
 
 		 415 aa  560  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1077  uracil-xanthine permease  65.2 
 
 		 425 aa  541  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1629  uracil-xanthine permease  63.34 
 
 		 427 aa  521  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0348661 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002783  uracil permease  62.56 
 
 		 417 aa  518  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2388  uracil permease  63.9 
 
 		 416 aa  517  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03198  hypothetical protein  62.08 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1749  uracil permease  61.26 
 
 		 417 aa  504  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.425461  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4298  uracil-xanthine permease  63.98 
 
 		 411 aa  504  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0402809 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1749  uracil-xanthine permease  61.81 
 
 		 409 aa  503  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000246667  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4318  uracil permease  58.39 
 
 		 441 aa  501  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0786  uracil-xanthine permease  60.05 
 
 		 424 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4444  uracil-xanthine permease  60.05 
 
 		 421 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.586178  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0745  uracil-xanthine permease  59.66 
 
 		 421 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0773  uracil-xanthine permease  59.66 
 
 		 421 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1980  uracil-xanthine permease  60.38 
 
 		 418 aa  486  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5296  uracil permease  60.29 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61480  uracil permease  60.05 
 
 		 427 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.202144 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0968  xanthine/uracil permease family protein  57.31 
 
 		 425 aa  481  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1784  uracil-xanthine permease  61.98 
 
 		 416 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000126712  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2162  uracil-xanthine permease  62.14 
 
 		 415 aa  481  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1777  uracil-xanthine permease  61.98 
 
 		 416 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000163317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1821  uracil-xanthine permease  61.48 
 
 		 416 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000647194  normal  0.178091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4729  xanthine/uracil permease  58.5 
 
 		 424 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.667812  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2501  uracil-xanthine permease  61.73 
 
 		 416 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000161239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1836  uracil-xanthine permease  63.22 
 
 		 411 aa  479  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0253304  normal  0.750298 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2443  uracil-xanthine permease  62.75 
 
 		 408 aa  478  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.161391  normal  0.0740726 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1649  uracil-xanthine permease  62.37 
 
 		 412 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00322133  hitchhiker  0.000377571 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1965  uracil-xanthine permease  60.83 
 
 		 418 aa  477  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0945  uracil-xanthine permease  59.48 
 
 		 420 aa  472  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2879  uracil permease  62.12 
 
 		 412 aa  474  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1449  uracil-xanthine permease  56.86 
 
 		 414 aa  472  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1918  uracil-xanthine permease  63.78 
 
 		 409 aa  472  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00881195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1574  uracil-xanthine permease  62.12 
 
 		 412 aa  474  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000671953  normal  0.0882987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1641  uracil-xanthine permease  61.87 
 
 		 412 aa  473  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000740931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1689  uracil-xanthine permease  61.56 
 
 		 412 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000578916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1129  uracil transporter  59.09 
 
 		 406 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0766553  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1641  uracil-xanthine permease  60.91 
 
 		 407 aa  463  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000923826  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0996  uracil-xanthine permease  59.05 
 
 		 411 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.594707  hitchhiker  0.00519474 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1967  uracil-xanthine permease  56.36 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.522211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2088  uracil-xanthine permease  57.83 
 
 		 412 aa  442  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1342  uracil permease  58.65 
 
 		 413 aa  444  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00369344  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2248  uracil-xanthine permease  55.1 
 
 		 421 aa  434  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00954559  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0997  uracil-xanthine permease  56.86 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0212  uracil permease  55.25 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0419  permease subfamily protein  54.25 
 
 		 411 aa  424  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0593  uracil permease (Uracil transporter)  54.25 
 
 		 412 aa  418  9.999999999999999e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0341896  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1126  uracil permease  48.62 
 
 		 395 aa  378  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.930887 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  47.63 
 
 		 415 aa  360  4e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0066  uracil-xanthine permease  44.39 
 
 		 403 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00626483  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2539  uracil-xanthine permease  48.12 
 
 		 427 aa  339  7e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.467539  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1252  uracil permease  48.13 
 
 		 427 aa  338  9e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3940  uracil permease  48.13 
 
 		 427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000267046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3989  uracil permease  48.13 
 
 		 427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000553719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  48.13 
 
 		 438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000779766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  48.13 
 
 		 438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  48.13 
 
 		 438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000513504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4029  uracil permease  48.13 
 
 		 427 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000132234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3904  uracil permease  48.13 
 
 		 427 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000015728 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3717  uracil-xanthine permease  47.63 
 
 		 430 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000736051  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0108  uracil-xanthine permease  46.13 
 
 		 399 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0107  uracil-xanthine permease  46.13 
 
 		 399 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.681241  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2371  uracil-xanthine permease  47.42 
 
 		 409 aa  336  5e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000154937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  47.88 
 
 		 427 aa  335  7e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0765  uracil permease  44.26 
 
 		 430 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1258  uracil permease  44.02 
 
 		 435 aa  321  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1283  uracil permease  44.02 
 
 		 435 aa  321  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.296835  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0606  uracil-xanthine permease  44.44 
 
 		 403 aa  308  9e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000016937  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1043  uracil-xanthine permease  47.73 
 
 		 434 aa  307  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000103466  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1913  uracil-xanthine permease  46.86 
 
 		 432 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  45.41 
 
 		 433 aa  300  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1089  uracil-xanthine permease  43.03 
 
 		 430 aa  298  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355646  hitchhiker  0.00900914 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1232  uracil permease  40.86 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.011581  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1422  uracil-xanthine permease  40.86 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0087754  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  40 
 
 		 423 aa  291  2e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0460  uracil-xanthine permease  40.49 
 
 		 423 aa  285  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000162343  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0910  uracil-xanthine permease  39.71 
 
 		 428 aa  279  7e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00327811 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1115  uracil-xanthine permease  39.34 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0429  uracil-xanthine permease  39.49 
 
 		 447 aa  278  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000136785  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1891  uracil-xanthine permease  45.85 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  38.85 
 
 		 457 aa  278  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1711  xanthine/uracil permease  41.58 
 
 		 430 aa  274  2.0000000000000002e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10659  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2865  uracil transporter  38.17 
 
 		 429 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0070  uracil-xanthine permease  43.14 
 
 		 432 aa  274  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0058  uracil-xanthine permease  43.14 
 
 		 432 aa  274  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2692  uracil transporter  39.23 
 
 		 429 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.312639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0054  uracil-xanthine permease  43.14 
 
 		 432 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  38.92 
 
 		 428 aa  272  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  38.92 
 
 		 428 aa  272  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2644  uracil transporter  39.08 
 
 		 429 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00659887  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2756  uracil transporter  39.23 
 
 		 429 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.895321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2734  uracil transporter  39.08 
 
 		 429 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  39.69 
 
 		 429 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04600  uracil-xanthine permease  38.68 
 
 		 467 aa  271  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0641313  hitchhiker  0.000000425239 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06450  uracil-xanthine permease  39.76 
 
 		 469 aa  271  2e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.285171  normal  0.461399 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  39.95 
 
 		 429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2985  uracil transporter  38.93 
 
 		 429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  0.0741995 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0490  xanthine/uracil permease  43.5 
 
 		 443 aa  270  4e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0186546  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>