More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0436 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  95.52 
 
 		 849 aa  1481    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  69.21 
 
 		 851 aa  1155    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  72.82 
 
 		 850 aa  1200    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 849 aa  1684    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  27.42 
 
 		 849 aa  271  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  28.85 
 
 		 870 aa  258  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  27.04 
 
 		 847 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  28.37 
 
 		 866 aa  248  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  27.88 
 
 		 850 aa  247  6e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  26.22 
 
 		 847 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  27.74 
 
 		 845 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  28.5 
 
 		 839 aa  221  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  24.82 
 
 		 855 aa  218  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  25.55 
 
 		 858 aa  211  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  29.76 
 
 		 837 aa  203  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  26.42 
 
 		 843 aa  189  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  28.22 
 
 		 841 aa  185  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  27.53 
 
 		 855 aa  181  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  28.44 
 
 		 843 aa  177  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  27.81 
 
 		 843 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  26.08 
 
 		 844 aa  162  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  28.89 
 
 		 845 aa  158  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  25.53 
 
 		 836 aa  152  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  26.2 
 
 		 884 aa  150  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  26.91 
 
 		 848 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  23.96 
 
 		 852 aa  141  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  25.49 
 
 		 846 aa  140  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  24.86 
 
 		 857 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  25.37 
 
 		 854 aa  140  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  28.06 
 
 		 847 aa  140  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  25.77 
 
 		 842 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  25.47 
 
 		 867 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  25.48 
 
 		 857 aa  135  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  28.04 
 
 		 861 aa  134  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  24.78 
 
 		 856 aa  133  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  23.79 
 
 		 858 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  28.55 
 
 		 859 aa  131  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  25.14 
 
 		 841 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  26.27 
 
 		 855 aa  129  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  28.87 
 
 		 868 aa  128  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  24.77 
 
 		 855 aa  127  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  24.39 
 
 		 855 aa  126  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  27.56 
 
 		 849 aa  125  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  29.25 
 
 		 821 aa  124  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  27.49 
 
 		 866 aa  121  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  27.58 
 
 		 853 aa  120  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  24.51 
 
 		 873 aa  119  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  25.81 
 
 		 825 aa  119  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  24.08 
 
 		 835 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  24.08 
 
 		 835 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  24.55 
 
 		 834 aa  118  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  26 
 
 		 838 aa  114  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  27.58 
 
 		 849 aa  111  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  25.24 
 
 		 853 aa  111  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  26.23 
 
 		 853 aa  108  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  29.93 
 
 		 877 aa  107  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  29.18 
 
 		 877 aa  104  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  26 
 
 		 866 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  22.86 
 
 		 889 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 839 aa  100  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  28.57 
 
 		 842 aa  98.6  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  25.69 
 
 		 857 aa  98.2  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  18.07 
 
 		 856 aa  97.8  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  28.61 
 
 		 842 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  25.36 
 
 		 821 aa  95.9  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.1 
 
 		 880 aa  95.5  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 		 842 aa  95.9  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  23.82 
 
 		 821 aa  95.1  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  26.04 
 
 		 855 aa  94.7  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  22.01 
 
 		 884 aa  94.7  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  22.82 
 
 		 879 aa  93.2  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.01 
 
 		 857 aa  91.3  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  26.08 
 
 		 820 aa  90.9  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  25.19 
 
 		 819 aa  90.1  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  28.92 
 
 		 827 aa  90.9  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  24.03 
 
 		 873 aa  90.1  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  25.85 
 
 		 806 aa  89.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  21.02 
 
 		 858 aa  89.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  22.12 
 
 		 889 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  24.07 
 
 		 793 aa  89  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  23.34 
 
 		 865 aa  87  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  25.53 
 
 		 871 aa  87.4  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  24.65 
 
 		 854 aa  86.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4468  protein of unknown function DUF214  23.4 
 
 		 855 aa  85.5  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  30.05 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  28.05 
 
 		 846 aa  84  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  25.66 
 
 		 861 aa  83.2  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  27.74 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.94 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  21.94 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  22.3 
 
 		 825 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  23.19 
 
 		 800 aa  81.6  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  24.22 
 
 		 878 aa  79.7  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  20.8 
 
 		 817 aa  79.3  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  23.05 
 
 		 897 aa  79  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.55 
 
 		 859 aa  78.2  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.56 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.33 
 
 		 423 aa  77  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2398  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.52 
 
 		 418 aa  77.4  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.93 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>