83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0384 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0384  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 
308 aa  633  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00197683  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1852  ThiJ/PfpI domain-containing protein  66.99 
 
 
312 aa  427  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1929  ThiJ/PfpI domain protein  54.02 
 
 
527 aa  305  5e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1905  ThiJ/PfpI domain protein  54.02 
 
 
521 aa  305  5e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0357  ThiJ/PfpI domain-containing protein  53.38 
 
 
500 aa  305  5e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4703  ThiJ/PfpI domain protein  48.38 
 
 
288 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2868  ThiJ/PfpI domain protein  49.03 
 
 
273 aa  276  4e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.653619  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0819  hypothetical protein  46.79 
 
 
288 aa  266  3e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0139271  unclonable  8.05455e-06 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0828  hypothetical protein  25.08 
 
 
254 aa  77.8  2e-13  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.775057  unclonable  1.12363e-05 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01950  conserved hypothetical protein  29.19 
 
 
233 aa  56.6  5e-07  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1312  ThiJ/PfpI  25.54 
 
 
227 aa  55.8  9e-07  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06796  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01430)  27.12 
 
 
237 aa  54.7  2e-06  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  24.36 
 
 
227 aa  53.5  4e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  25.12 
 
 
227 aa  52.8  8e-06  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2725  ThiJ/PfpI domain protein  23.13 
 
 
228 aa  52.8  8e-06  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.693547 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.84 
 
 
224 aa  52  1e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  28.22 
 
 
246 aa  52  1e-05  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3509  DJ-1/PfpI family protein  27.11 
 
 
270 aa  51.2  2e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.962862  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.57 
 
 
228 aa  51.6  2e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  21.97 
 
 
230 aa  51.2  2e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  24.84 
 
 
226 aa  50.4  4e-05  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  24.84 
 
 
226 aa  50.4  4e-05  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  24.84 
 
 
226 aa  50.4  4e-05  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  26.71 
 
 
254 aa  50.4  4e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  24.84 
 
 
226 aa  50.4  4e-05  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  24.84 
 
 
226 aa  50.4  4e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  24.84 
 
 
226 aa  50.4  4e-05  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  24.84 
 
 
226 aa  50.4  4e-05  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  23.57 
 
 
227 aa  50.1  5e-05  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  25.3 
 
 
261 aa  50.1  5e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  25.23 
 
 
233 aa  50.1  5e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3480  ThiJ/PfpI  33.96 
 
 
241 aa  50.1  5e-05  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.782484 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1929  ThiJ/PfpI domain protein  39.47 
 
 
226 aa  49.7  7e-05  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6825  ThiJ/PfpI domain protein  39.73 
 
 
233 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.397498 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1713  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.04 
 
 
231 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.45636 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  25.08 
 
 
230 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1020  ThiJ/PfpI domain protein  25.23 
 
 
226 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.276045  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.23 
 
 
227 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  24.47 
 
 
229 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.56 
 
 
225 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.46139e-07 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  22.56 
 
 
224 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl402  putative PFPI-like cystiene protease  30.88 
 
 
226 aa  48.1  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2163  ThiJ/PfpI  35.71 
 
 
251 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.843992  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  26.85 
 
 
230 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  28.75 
 
 
225 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  23.32 
 
 
230 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.36 
 
 
231 aa  47  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0630  DJ-1/PfpI family protein  22.76 
 
 
250 aa  46.6  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0780  ThiJ/PfpI domain protein  22.76 
 
 
250 aa  46.6  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  23.23 
 
 
228 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.85 
 
 
228 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4178  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.57 
 
 
228 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0592  ThiJ/PfpI domain protein  35.9 
 
 
228 aa  46.2  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4593  thiJ/pfpI family protein  27.44 
 
 
220 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.69 
 
 
231 aa  45.8  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2435  ThiJ/PfpI  23.75 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0616899  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  21.09 
 
 
230 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  21.48 
 
 
230 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1143  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.52 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.505852 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  21.61 
 
 
226 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.49 
 
 
229 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  25.58 
 
 
229 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  21.48 
 
 
232 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  21.48 
 
 
230 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.61 
 
 
229 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  27.78 
 
 
229 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  27.78 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  28.57 
 
 
221 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  24.77 
 
 
245 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4627  thiJ/pfpI family protein  26.83 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02417  ThiJ/PfpI family protein  22.01 
 
 
232 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.847717  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.08 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4578  thiJ/pfpI family protein  26.83 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  30 
 
 
221 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  29.57 
 
 
225 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  36.11 
 
 
230 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  36.11 
 
 
230 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  23.62 
 
 
225 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  23.59 
 
 
225 aa  43.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0944  ThiJ/PfpI family protein  29.51 
 
 
219 aa  43.1  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.78 
 
 
242 aa  42.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1679  ThiJ/PfpI domain protein  21.52 
 
 
279 aa  42.7  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0958  ThiJ/PfpI domain protein  20.48 
 
 
225 aa  42.4  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>