35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0381 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0381  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 277 aa  541  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0363  Fibronectin type III domain protein  81.91 
 
 		 278 aa  340  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00588673 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  55.56 
 
 		 683 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  52.63 
 
 		 656 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  57.58 
 
 		 692 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1793  fibronectin type III domain-containing protein  46.07 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1004  von Willebrand factor type D protein  42.86 
 
 		 2998 aa  70.5  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  38 
 
 		 1067 aa  68.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  47.25 
 
 		 1879 aa  55.8  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  40.37 
 
 		 1199 aa  54.7  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  36.94 
 
 		 782 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  36.54 
 
 		 1847 aa  53.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  34.96 
 
 		 744 aa  52.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0957  hypothetical protein  39.76 
 
 		 1994 aa  52  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.736873  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  35.2 
 
 		 9585 aa  50.4  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  38.18 
 
 		 834 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  38.3 
 
 		 1401 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1747  hypothetical protein  30.12 
 
 		 1139 aa  49.7  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564232 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  41.98 
 
 		 2192 aa  49.3  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  32.79 
 
 		 739 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  40.38 
 
 		 869 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  33.57 
 
 		 739 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2391  fibronectin, type III domain-containing protein  40 
 
 		 631 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00263498  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  31.93 
 
 		 725 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  39.45 
 
 		 460 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  41.18 
 
 		 1550 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  39.81 
 
 		 2042 aa  46.6  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  34.78 
 
 		 1401 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  31.71 
 
 		 3027 aa  46.2  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6593  fibronectin type III domain-containing protein  33.63 
 
 		 428 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  36.08 
 
 		 918 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  32.61 
 
 		 864 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  43.18 
 
 		 1911 aa  43.5  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  39.22 
 
 		 1307 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  36.59 
 
 		 2011 aa  42.7  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>