More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0367 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  100 
 
 
285 aa  585  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  98.6 
 
 
285 aa  578  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  61.23 
 
 
282 aa  368  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  46.52 
 
 
282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  40.38 
 
 
281 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2028  putative signal transduction protein  44.27 
 
 
279 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  39.78 
 
 
276 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  38.79 
 
 
275 aa  209  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2112  metal dependent phosphohydrolase  40.6 
 
 
282 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  36.2 
 
 
283 aa  199  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1039  putative signal transduction protein  39.15 
 
 
273 aa  171  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  27.64 
 
 
282 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  28.72 
 
 
297 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  26.01 
 
 
283 aa  105  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  26.71 
 
 
284 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  26.6 
 
 
283 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  29.13 
 
 
280 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  29.76 
 
 
302 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  27.39 
 
 
297 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  25.7 
 
 
300 aa  99  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  26.38 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  29 
 
 
427 aa  97.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  31.39 
 
 
397 aa  97.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  28.33 
 
 
280 aa  96.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  25.45 
 
 
284 aa  96.3  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  29.91 
 
 
378 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  24.64 
 
 
303 aa  95.9  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  27.85 
 
 
292 aa  95.9  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  28.31 
 
 
285 aa  95.5  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  28.21 
 
 
304 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  26.39 
 
 
282 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  28.57 
 
 
369 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 
427 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  27.97 
 
 
455 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  26.53 
 
 
407 aa  92.8  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  29.61 
 
 
287 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2040  hypothetical protein  26.79 
 
 
397 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414414  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  28.47 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  26.86 
 
 
289 aa  90.5  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  26.28 
 
 
352 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  30.26 
 
 
286 aa  90.1  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  26.84 
 
 
298 aa  89.7  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1923  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 
395 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1838  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 
395 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  30.54 
 
 
397 aa  87.8  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  26.36 
 
 
283 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  26.62 
 
 
280 aa  87.8  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  27.04 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  27.87 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 
408 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 
284 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  25.88 
 
 
297 aa  86.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  25.11 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  30.59 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  26.61 
 
 
412 aa  85.5  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  24.29 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  30.85 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  24.47 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
280 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  25.91 
 
 
430 aa  83.2  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  26.01 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  24.54 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  28.14 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  26.82 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  26.56 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  26.77 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  26.81 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  26.36 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  25.46 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  25.46 
 
 
288 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  23.9 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  26.96 
 
 
425 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  26.64 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  27 
 
 
287 aa  77  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  26.22 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  23.4 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  31.09 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  26.64 
 
 
409 aa  76.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  28.88 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  24.76 
 
 
288 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  24.81 
 
 
288 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  24.36 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  31.48 
 
 
283 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  28.14 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  31.25 
 
 
415 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  27.98 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  25.85 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3473  putative signal transduction protein  26.74 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  25.47 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  28.43 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  22.48 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  24.62 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  27.01 
 
 
517 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  26.7 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  26.67 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  26.27 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  23.5 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  25 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>