68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0320 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0320  protein of unknown function DUF107  100 
 
 		 152 aa  303  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0323  protein of unknown function DUF107  99.34 
 
 		 152 aa  303  6e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  70.67 
 
 		 152 aa  228  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0296  protein of unknown function DUF107  86.18 
 
 		 152 aa  220  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  52.03 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  52.38 
 
 		 150 aa  161  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  47.95 
 
 		 151 aa  146  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3109  protein of unknown function DUF107  50 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00574825  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  46.9 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  44.44 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  41.1 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  41.67 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  42.86 
 
 		 143 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  43.75 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0261  hypothetical protein  41.78 
 
 		 146 aa  120  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  42.36 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2452  hypothetical protein  41.78 
 
 		 165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0087  hypothetical protein  29.79 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3149  hypothetical protein  41.43 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.722841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  30.41 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  26.53 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0461  protein of unknown function DUF107  28.08 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  25.35 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  25.35 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  32.21 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  32.47 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  25.35 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  25.35 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  32.19 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  24.65 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  25.35 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  25.35 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  23.94 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  30.77 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  24.65 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  23.94 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  23.94 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  28.95 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  28.77 
 
 		 489 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  24.31 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1634  hypothetical protein  27.66 
 
 		 459 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  24.68 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0964  hypothetical protein  26.92 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  26.85 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  0.000000302368 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  28.85 
 
 		 496 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  26.49 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  24.82 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  24.65 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  34.72 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06891  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  28.77 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  27.44 
 
 		 437 aa  45.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  25 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  25.85 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  27.54 
 
 		 429 aa  44.3  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5110  hypothetical protein  33.11 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000397496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1213  protein of unknown function DUF107  30.72 
 
 		 439 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00310663  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  26.21 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  27.86 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  29.68 
 
 		 430 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  30.46 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  34.19 
 
 		 433 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  30.82 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  35.71 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  27.74 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1187  protein of unknown function DUF107  26.39 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  36.84 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0549  inner membrane protein YbbJ  24.24 
 
 		 150 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>