24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0311 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0311  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  186  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.34678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0295  hypothetical protein  94.62 
 
 		 93 aa  176  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2961  hypothetical protein  84.95 
 
 		 93 aa  157  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0352  hypothetical protein  60.87 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7032  hypothetical protein  52.69 
 
 		 93 aa  107  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00925543  normal  0.081206 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1311  hypothetical protein  56.52 
 
 		 94 aa  103  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328492  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3471  hypothetical protein  67.39 
 
 		 94 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0482  hypothetical protein  52.22 
 
 		 116 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000043148  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0040  hypothetical protein  55.68 
 
 		 94 aa  96.7  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0655  hypothetical protein  63.04 
 
 		 94 aa  93.6  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236003  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0156  hypothetical protein  56.52 
 
 		 94 aa  88.6  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4454  transcriptional regulator, Fis family  53.33 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121305  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0607  hypothetical protein  57.61 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2964  Fis family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3584  hypothetical protein  58.89 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4064  hypothetical protein  58.89 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1854  hypothetical protein  58.89 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703432  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3340  hypothetical protein  58.89 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.652813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3974  Fis family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.984172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1578  hypothetical protein  58.43 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206064  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1498  hypothetical protein  55.07 
 
 		 74 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.743357  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4177  hypothetical protein  57.78 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.84562  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4190  hypothetical protein  57.78 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1002  hypothetical protein  48.31 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0256071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>