More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0279 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  100 
 
 		 274 aa  566  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  98.54 
 
 		 274 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  80.07 
 
 		 276 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  79.18 
 
 		 286 aa  450  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  78.07 
 
 		 277 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  62.73 
 
 		 273 aa  353  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  61.11 
 
 		 271 aa  345  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  60.84 
 
 		 273 aa  332  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  60.82 
 
 		 272 aa  332  6e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  59.77 
 
 		 275 aa  331  6e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  61.48 
 
 		 271 aa  327  9e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  57.78 
 
 		 271 aa  323  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  56.55 
 
 		 277 aa  321  8e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  56.09 
 
 		 274 aa  317  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  55.72 
 
 		 274 aa  315  4e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  55.68 
 
 		 282 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  56.23 
 
 		 279 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  53.16 
 
 		 281 aa  301  6.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  55.68 
 
 		 269 aa  301  8.000000000000001e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  56.77 
 
 		 273 aa  299  3e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  52.16 
 
 		 286 aa  295  4e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  53.56 
 
 		 281 aa  293  2e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  54.68 
 
 		 272 aa  293  2e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  54.94 
 
 		 284 aa  291  8e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  54.34 
 
 		 279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  53.21 
 
 		 275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  52.83 
 
 		 275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  52.83 
 
 		 273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  53.21 
 
 		 275 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  51.48 
 
 		 689 aa  280  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  53.64 
 
 		 275 aa  277  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  56.23 
 
 		 278 aa  275  7e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  53.26 
 
 		 275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  48.19 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  49.82 
 
 		 297 aa  262  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  48.66 
 
 		 265 aa  261  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  46.74 
 
 		 303 aa  258  7e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.1 
 
 		 555 aa  250  2e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  48.67 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  47.48 
 
 		 303 aa  249  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  45.11 
 
 		 279 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  48.39 
 
 		 303 aa  248  6e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  48.09 
 
 		 273 aa  245  6e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  46.3 
 
 		 276 aa  241  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  45.76 
 
 		 280 aa  238  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  48.54 
 
 		 280 aa  237  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  44.79 
 
 		 277 aa  237  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  44.52 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  44.53 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  46.59 
 
 		 606 aa  230  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  45.38 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  46.21 
 
 		 305 aa  229  4e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  45.85 
 
 		 281 aa  229  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  46.37 
 
 		 291 aa  227  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  44.53 
 
 		 288 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  46.3 
 
 		 293 aa  226  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  45.32 
 
 		 280 aa  225  6e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  41.85 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  41.85 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  41.85 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  41.85 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  44.4 
 
 		 280 aa  223  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  41.48 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  41.48 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  44.4 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  44.57 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  40.75 
 
 		 289 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  42.91 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  43.01 
 
 		 299 aa  218  6e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  45.29 
 
 		 303 aa  218  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  40.68 
 
 		 294 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  41.86 
 
 		 263 aa  216  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  42.48 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  43.33 
 
 		 282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  41.6 
 
 		 269 aa  211  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  44.49 
 
 		 302 aa  211  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  41.98 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  41.86 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  42.91 
 
 		 285 aa  209  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  41.79 
 
 		 281 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  42.07 
 
 		 624 aa  208  6e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  44.53 
 
 		 623 aa  208  8e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  42.91 
 
 		 277 aa  208  9e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  40.53 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  42.97 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  40.67 
 
 		 282 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  44.44 
 
 		 280 aa  205  6e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0048  transketolase domain-containing protein  43.38 
 
 		 282 aa  205  7e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  39.77 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  40.53 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  42.86 
 
 		 631 aa  202  6e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  40.73 
 
 		 621 aa  202  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  43.54 
 
 		 618 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3642  transketolase domain-containing protein  40.53 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0863468 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  41.11 
 
 		 276 aa  198  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  39.77 
 
 		 285 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1302  transketolase  44.27 
 
 		 653 aa  198  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0226315  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4931  transketolase domain-containing protein  41.67 
 
 		 281 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1716  Transketolase domain protein  41.27 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  41.7 
 
 		 630 aa  198  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>