19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0247 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0247  uncharacterized protein-like protein  100 
 
 		 90 aa  183  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000137901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0231  protein of unknown function DUF507  95.56 
 
 		 90 aa  180  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4304  hypothetical protein  84.44 
 
 		 90 aa  160  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280158  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0026  hypothetical protein  74.44 
 
 		 90 aa  144  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000833751  normal  0.852253 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3336  hypothetical protein  74.44 
 
 		 90 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051495  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1310  hypothetical protein  54.55 
 
 		 86 aa  97.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000733795  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1668  hypothetical protein  33.72 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1843  hypothetical protein  33.72 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1487  hypothetical protein  33.72 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0079  hypothetical protein  35.29 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.11602  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0896  hypothetical protein  30.59 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0718  competence/damage-inducible domain-containing protein  29.41 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185967  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0373  hypothetical protein  34.12 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0598173  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1924  protein of unknown function DUF507  34.12 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0371  conserved hypothetical protein (DUF507 domain protein)  31.4 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1366  hypothetical protein  29.41 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4175  hypothetical protein  34.88 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.570321  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1146  protein of unknown function DUF507  30.34 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0092  hypothetical protein  33.67 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000100169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>