More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0222 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 464 aa  945    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  86.42 
 
 		 463 aa  810    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  56.9 
 
 		 464 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.66 
 
 		 593 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1162  transcriptional regulator, GntR family  41.81 
 
 		 479 aa  371  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.06 
 
 		 465 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.01 
 
 		 486 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 473 aa  354  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1890  GntR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 466 aa  349  6e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0766739  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2170  GntR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 466 aa  348  8e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662886  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  40.39 
 
 		 466 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  40.48 
 
 		 466 aa  347  4e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0708  transcriptional regulator, GntR family  38.74 
 
 		 466 aa  346  6e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0551  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 466 aa  345  8e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0582  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 466 aa  345  8e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.915495  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1938  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 466 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1937  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 466 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2085  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 466 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1900  GntR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000823779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0495  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0638  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 466 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0496  transcriptional regulator  38.96 
 
 		 466 aa  342  8e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0493  GntR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 466 aa  342  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.393759  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 480 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  39.18 
 
 		 471 aa  339  7e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4719  transcriptional regulator, GntR family  38.44 
 
 		 466 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0646  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 473 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0620  transcriptional regulator, GntR family  38.01 
 
 		 466 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  39.01 
 
 		 463 aa  335  9e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  38.74 
 
 		 471 aa  335  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  38.66 
 
 		 463 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.73 
 
 		 474 aa  317  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2363  GntR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 459 aa  312  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0989  transcriptional regulator  35.79 
 
 		 473 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0129526  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07570  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  35.89 
 
 		 491 aa  303  6.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal  0.392489 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18480  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  37.58 
 
 		 488 aa  298  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.423474  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0157  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 454 aa  298  2e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.790011  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 490 aa  298  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.49 
 
 		 472 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690216  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 496 aa  286  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 477 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0540  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 460 aa  282  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0554  regulatory protein GntR HTH  34.42 
 
 		 460 aa  282  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 510 aa  278  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.82 
 
 		 485 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.25 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.03 
 
 		 472 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 494 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  35.58 
 
 		 509 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02430  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  35.76 
 
 		 478 aa  272  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  36.48 
 
 		 495 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  34.3 
 
 		 508 aa  270  4e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1064  transcriptional regulator  37.66 
 
 		 477 aa  270  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 470 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.53 
 
 		 489 aa  269  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 494 aa  269  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  36.64 
 
 		 490 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 494 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 494 aa  266  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 494 aa  266  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  35.03 
 
 		 503 aa  263  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  36.57 
 
 		 476 aa  263  6.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  35.28 
 
 		 492 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 502 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  35.32 
 
 		 502 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 502 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 502 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 485 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 503 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 492 aa  261  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 495 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 501 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 475 aa  260  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  35.32 
 
 		 502 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 507 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  32.3 
 
 		 504 aa  259  7e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 509 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 504 aa  259  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  34.24 
 
 		 509 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.16 
 
 		 501 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 492 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 493 aa  257  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 507 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 492 aa  257  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 487 aa  256  7e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 509 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 485 aa  255  9e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05334  transcriptional regulator  35.89 
 
 		 470 aa  255  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  34.94 
 
 		 520 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 475 aa  254  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.28 
 
 		 471 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 488 aa  253  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 490 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 509 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.05 
 
 		 507 aa  252  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.18 
 
 		 504 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4413  transcriptional regulator  37.72 
 
 		 490 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 523 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>