15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0198 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0198  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  536  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0181  hypothetical protein  98.08 
 
 
261 aa  528  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000193703 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1426  hypothetical protein  53.18 
 
 
276 aa  283  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08350  hypothetical protein  40 
 
 
265 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1913  hypothetical protein  36.98 
 
 
265 aa  199  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312193  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0617  hypothetical protein  35.34 
 
 
273 aa  186  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3042  hypothetical protein  38.75 
 
 
273 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000144784  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2901  hypothetical protein  33.33 
 
 
297 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  26.47 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  36.26 
 
 
283 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  35.29 
 
 
220 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  29.17 
 
 
276 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  31.58 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  33.77 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  34.74 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>