259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0186 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
395 aa  820    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  98.23 
 
 
395 aa  810    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  66.33 
 
 
395 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  60.86 
 
 
396 aa  520  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  45.66 
 
 
397 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  42.11 
 
 
884 aa  341  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  42.25 
 
 
423 aa  340  4e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  42.97 
 
 
878 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  42.9 
 
 
399 aa  336  5e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  42.71 
 
 
878 aa  335  9e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  42.63 
 
 
399 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  41.97 
 
 
407 aa  332  5e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  40.83 
 
 
425 aa  331  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  39.8 
 
 
407 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  39.49 
 
 
400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  40.67 
 
 
407 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  40.31 
 
 
407 aa  319  6e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  39.48 
 
 
407 aa  318  9e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  42.39 
 
 
421 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  42.38 
 
 
409 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  38.48 
 
 
508 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  40.41 
 
 
407 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  40.9 
 
 
431 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  36.88 
 
 
399 aa  250  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.79 
 
 
394 aa  247  3e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  35.38 
 
 
393 aa  243  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  36.11 
 
 
405 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  34.34 
 
 
401 aa  240  4e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  32.91 
 
 
399 aa  239  5e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  35.28 
 
 
405 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.76 
 
 
396 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  32.32 
 
 
392 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1933  beta-lactamase domain-containing protein  37.28 
 
 
396 aa  237  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.837392  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  35.25 
 
 
402 aa  237  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  33.84 
 
 
396 aa  236  5.0000000000000005e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1198  beta-lactamase domain-containing protein  32.53 
 
 
384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.523487  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.08 
 
 
397 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.49 
 
 
574 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  34.1 
 
 
395 aa  230  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  32.26 
 
 
401 aa  230  4e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  32.13 
 
 
396 aa  229  5e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.62 
 
 
575 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  34.54 
 
 
397 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000136277  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  35.43 
 
 
397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  31.39 
 
 
392 aa  225  9e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  33.58 
 
 
403 aa  225  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  32 
 
 
572 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  32.88 
 
 
571 aa  223  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0770  flavin reductase-like, FMN-binding  32.09 
 
 
574 aa  223  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.82 
 
 
575 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  32.6 
 
 
575 aa  221  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  32.66 
 
 
418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  32.23 
 
 
396 aa  220  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  32.88 
 
 
579 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  32.05 
 
 
387 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32 
 
 
479 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0125184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32 
 
 
479 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  32 
 
 
479 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.09 
 
 
575 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.75 
 
 
479 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.75 
 
 
479 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.24 
 
 
576 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32 
 
 
479 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.75 
 
 
479 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32 
 
 
479 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32 
 
 
479 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0012  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.66 
 
 
400 aa  218  1e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.143481  normal  0.0465587 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  32.9 
 
 
393 aa  218  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32 
 
 
479 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  32 
 
 
479 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.96 
 
 
576 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.75 
 
 
479 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.09 
 
 
575 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.08 
 
 
500 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  32.56 
 
 
387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  32.92 
 
 
402 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  31.63 
 
 
397 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33 
 
 
498 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32 
 
 
479 aa  215  9e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.75 
 
 
493 aa  215  9e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0432  beta-lactamase domain-containing protein  34.65 
 
 
404 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253728  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  29.04 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  32.59 
 
 
404 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  32.13 
 
 
387 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.33 
 
 
505 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.83 
 
 
504 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.5 
 
 
479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  31.08 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1369  flavin reductase-like, FMN-binding  32.72 
 
 
575 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.018202 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.25 
 
 
482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  34.25 
 
 
406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  31.41 
 
 
398 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  34.25 
 
 
406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  32.3 
 
 
387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0805  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.91 
 
 
573 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.23 
 
 
499 aa  213  5.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  33.25 
 
 
387 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  30.98 
 
 
582 aa  211  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0834  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.65 
 
 
573 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.293861  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.76 
 
 
494 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>