More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0114 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0114  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 735 aa  1451    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0095  heavy metal translocating P-type ATPase  91.56 
 
 		 735 aa  1241    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000615428 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0711  heavy metal translocating P-type ATPase  35.1 
 
 		 712 aa  410  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  38.41 
 
 		 804 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  37.63 
 
 		 809 aa  352  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  35.87 
 
 		 815 aa  351  2e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  36.22 
 
 		 807 aa  351  3e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  37.27 
 
 		 817 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  37.27 
 
 		 817 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  34.98 
 
 		 743 aa  347  4e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  36.41 
 
 		 846 aa  346  8e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  36.45 
 
 		 814 aa  346  1e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3504  heavy metal translocating P-type ATPase  37.63 
 
 		 743 aa  345  2e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  39.1 
 
 		 809 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  37.64 
 
 		 823 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0911  heavy metal translocating P-type ATPase  37.16 
 
 		 831 aa  343  5e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  37.4 
 
 		 807 aa  343  7e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  37.99 
 
 		 755 aa  343  8e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  36.71 
 
 		 724 aa  343  9e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  35.49 
 
 		 797 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  38.61 
 
 		 787 aa  341  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3091  copper-translocating P-type ATPase  37.9 
 
 		 868 aa  341  4e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344658  normal  0.403922 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  36.72 
 
 		 808 aa  340  5e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1072  heavy metal translocating P-type ATPase  37.94 
 
 		 755 aa  339  9e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  36.42 
 
 		 801 aa  339  9e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 841 aa  339  9.999999999999999e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  38.98 
 
 		 852 aa  339  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 795 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  39.26 
 
 		 806 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  34.18 
 
 		 815 aa  337  3.9999999999999995e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  36.82 
 
 		 804 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  36.21 
 
 		 806 aa  336  9e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  37.44 
 
 		 833 aa  335  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  36.2 
 
 		 815 aa  335  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  36.2 
 
 		 815 aa  335  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1339  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 807 aa  334  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527377  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  36.88 
 
 		 773 aa  335  3e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  36.45 
 
 		 788 aa  334  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  35.63 
 
 		 737 aa  334  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  37.17 
 
 		 772 aa  333  5e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  38.27 
 
 		 855 aa  333  5e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  33.88 
 
 		 798 aa  333  6e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1259  heavy metal translocating P-type ATPase  38.73 
 
 		 834 aa  333  6e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  36.05 
 
 		 815 aa  333  8e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2772  copper-translocating P-type ATPase  36.06 
 
 		 757 aa  333  9e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  36.64 
 
 		 840 aa  332  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  37.6 
 
 		 1020 aa  331  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  36.06 
 
 		 868 aa  332  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  37.2 
 
 		 895 aa  332  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  35.15 
 
 		 836 aa  332  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  37.72 
 
 		 793 aa  332  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  37.36 
 
 		 792 aa  331  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0385  heavy metal translocating P-type ATPase  39.19 
 
 		 729 aa  331  4e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.530219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  35.14 
 
 		 846 aa  330  4e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  36.93 
 
 		 762 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  37.04 
 
 		 792 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  36.57 
 
 		 818 aa  330  6e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2453  heavy metal translocating P-type ATPase  37.36 
 
 		 765 aa  330  6e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  37.83 
 
 		 792 aa  330  6e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  36.93 
 
 		 762 aa  330  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  36.93 
 
 		 762 aa  330  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  36.38 
 
 		 799 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  34.96 
 
 		 838 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  36.93 
 
 		 767 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  37.18 
 
 		 762 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  33.28 
 
 		 828 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  36.54 
 
 		 846 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  36.9 
 
 		 800 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  37.63 
 
 		 807 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  37.69 
 
 		 833 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4130  copper-translocating P-type ATPase  38.81 
 
 		 799 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  35.59 
 
 		 905 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  36.39 
 
 		 798 aa  328  3e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  37.67 
 
 		 824 aa  328  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  32.57 
 
 		 796 aa  328  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  38.53 
 
 		 836 aa  328  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  38.53 
 
 		 836 aa  328  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0180  copper-translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 801 aa  327  4.0000000000000003e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  35.61 
 
 		 806 aa  326  7e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  36.75 
 
 		 799 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  33.84 
 
 		 828 aa  326  8.000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2153  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 724 aa  326  8.000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00626662  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3170  heavy metal translocating P-type ATPase  36.58 
 
 		 936 aa  326  9e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1587  copper/silver efflux P-type ATPase  36.68 
 
 		 814 aa  325  1e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.602341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  36.3 
 
 		 799 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  32.82 
 
 		 794 aa  325  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.54 
 
 		 732 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  33.01 
 
 		 894 aa  325  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  36.23 
 
 		 836 aa  325  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  37.54 
 
 		 790 aa  325  3e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1499  copper-translocating P-type ATPase  36.82 
 
 		 744 aa  325  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  34.39 
 
 		 826 aa  325  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  38.01 
 
 		 839 aa  324  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.42 
 
 		 814 aa  324  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  33.77 
 
 		 794 aa  323  5e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  38.5 
 
 		 786 aa  323  5e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2846  copper-translocating P-type ATPase  36.82 
 
 		 744 aa  323  5e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.515584  hitchhiker  0.000113532 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1505  copper-translocating P-type ATPase  36.65 
 
 		 744 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  35.3 
 
 		 715 aa  323  7e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  35.41 
 
 		 831 aa  323  7e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>