10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0109 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0109  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  329  9e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0090  hypothetical protein  92.45 
 
 		 159 aa  312  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000404111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0288  hypothetical protein  63.06 
 
 		 157 aa  203  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000794699  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0038  putative lipoprotein  58.9 
 
 		 162 aa  197  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3526  putative lipoprotein  67.89 
 
 		 163 aa  164  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.118888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2422  hypothetical protein  40.54 
 
 		 316 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0248233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3495  hypothetical protein  25 
 
 		 228 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.166316  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3026  hypothetical protein  37.84 
 
 		 326 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.906877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4221  hypothetical protein  37.84 
 
 		 316 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2704  hypothetical protein  37.84 
 
 		 329 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0700499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>