More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0034 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  67.66 
 
 		 592 aa  795    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  70.74 
 
 		 602 aa  852    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  100 
 
 		 603 aa  1219    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  95.52 
 
 		 602 aa  1164    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  60.13 
 
 		 625 aa  747    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  72.4 
 
 		 616 aa  884    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  55.03 
 
 		 621 aa  622  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  45.91 
 
 		 594 aa  550  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  44.93 
 
 		 622 aa  532  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  44.71 
 
 		 600 aa  520  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  42.48 
 
 		 600 aa  509  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  41.84 
 
 		 611 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  42.52 
 
 		 608 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  41.26 
 
 		 613 aa  501  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  41.33 
 
 		 611 aa  501  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  42.01 
 
 		 619 aa  500  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  43.57 
 
 		 592 aa  497  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  40.54 
 
 		 614 aa  496  1e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  41.16 
 
 		 603 aa  496  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  42.32 
 
 		 611 aa  483  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  43.32 
 
 		 610 aa  479  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  38.19 
 
 		 586 aa  472  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  38.89 
 
 		 591 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  38.99 
 
 		 588 aa  460  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  37.42 
 
 		 589 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  39.16 
 
 		 607 aa  455  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  39.6 
 
 		 650 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  38.75 
 
 		 588 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  38.93 
 
 		 587 aa  451  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  42.44 
 
 		 642 aa  449  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  38.18 
 
 		 590 aa  450  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  37.79 
 
 		 635 aa  449  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  41.78 
 
 		 617 aa  440  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0039  putative ATP-binding component of a transport system  42.4 
 
 		 588 aa  442  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0738965  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  38.96 
 
 		 597 aa  437  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  40.57 
 
 		 608 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  39.42 
 
 		 623 aa  427  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  38.84 
 
 		 602 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  36.35 
 
 		 588 aa  424  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  40.57 
 
 		 610 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  37.18 
 
 		 587 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1467  ABC transporter related  39.03 
 
 		 603 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000245046  normal  0.820859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  40.74 
 
 		 610 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  38.76 
 
 		 609 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  35.88 
 
 		 586 aa  421  1e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  37.82 
 
 		 594 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  36.84 
 
 		 587 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  37.14 
 
 		 610 aa  416  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.16 
 
 		 587 aa  412  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  36.99 
 
 		 587 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 		 587 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 		 587 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  36.59 
 
 		 584 aa  410  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.99 
 
 		 587 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.99 
 
 		 587 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  38.79 
 
 		 598 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3035  ABC transporter-like protein protein  39.07 
 
 		 626 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.82 
 
 		 587 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  37.8 
 
 		 587 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4342  ABC transporter, transmembrane region  39.21 
 
 		 626 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  36.82 
 
 		 587 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  39.31 
 
 		 594 aa  402  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  39.7 
 
 		 614 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  39.23 
 
 		 622 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  38.16 
 
 		 592 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  38.12 
 
 		 598 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  36.97 
 
 		 592 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  37.12 
 
 		 578 aa  396  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  40.27 
 
 		 608 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  36.46 
 
 		 607 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  36.51 
 
 		 585 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  40.77 
 
 		 620 aa  392  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  37.54 
 
 		 599 aa  390  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  38.14 
 
 		 637 aa  388  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  38.59 
 
 		 609 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  35.4 
 
 		 597 aa  385  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.59 
 
 		 589 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  37.92 
 
 		 632 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3227  ABC transporter-related protein  39 
 
 		 675 aa  383  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  37.65 
 
 		 632 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  38.32 
 
 		 606 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  35.23 
 
 		 594 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  36.96 
 
 		 592 aa  381  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  41.43 
 
 		 677 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  39.35 
 
 		 636 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0118  ABC transporter related  36.6 
 
 		 645 aa  377  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00403697  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0880  ABC transporter related  36.47 
 
 		 579 aa  376  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000184481  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0902  ABC transporter related  36.47 
 
 		 579 aa  376  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00896089  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1891  multidrug ABC transporter  38.14 
 
 		 598 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  38.61 
 
 		 600 aa  375  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  35.15 
 
 		 597 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  35.64 
 
 		 625 aa  372  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  35.59 
 
 		 588 aa  372  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4431  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.86 
 
 		 666 aa  372  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0490625  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0752  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  36.55 
 
 		 666 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0907  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.48 
 
 		 666 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0151268  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  33.85 
 
 		 617 aa  372  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0686  ABC transporter-related protein  37.59 
 
 		 666 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0199671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.62 
 
 		 586 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.51 
 
 		 586 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>