More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0033 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  61.66 
 
 		 610 aa  688    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  100 
 
 		 569 aa  1137    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  58.54 
 
 		 611 aa  694    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  96.66 
 
 		 569 aa  1078    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  67.16 
 
 		 541 aa  746    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0447  ABC transporter related  53.49 
 
 		 604 aa  545  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3410  ABC transporter related  51.06 
 
 		 588 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  41.26 
 
 		 582 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  40.18 
 
 		 588 aa  431  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  39.72 
 
 		 591 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  38.31 
 
 		 583 aa  417  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  36.57 
 
 		 589 aa  414  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 578 aa  408  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  40.07 
 
 		 583 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  39.02 
 
 		 650 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  37.83 
 
 		 586 aa  404  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  37.43 
 
 		 586 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  37.7 
 
 		 587 aa  395  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  37.88 
 
 		 604 aa  396  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  38.41 
 
 		 598 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  40.76 
 
 		 572 aa  395  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  37.12 
 
 		 598 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  38.6 
 
 		 603 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1468  ABC transporter related  36.74 
 
 		 627 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.308401  normal  0.364804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  36.31 
 
 		 607 aa  385  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  36.28 
 
 		 585 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  38.69 
 
 		 583 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  36.98 
 
 		 590 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  37.81 
 
 		 579 aa  379  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  36.29 
 
 		 585 aa  380  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  37.54 
 
 		 641 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  37.77 
 
 		 571 aa  380  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1251  cyclic nucleotide-binding protein  38.4 
 
 		 607 aa  382  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  35.04 
 
 		 573 aa  375  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  34.53 
 
 		 573 aa  376  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  39.24 
 
 		 600 aa  378  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  35.14 
 
 		 592 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  34.92 
 
 		 583 aa  375  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  34.46 
 
 		 583 aa  374  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09251  multidrug ABC transporter  35.26 
 
 		 583 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.532954  normal  0.0147253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  36.35 
 
 		 593 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0256  multidrug ABC transporter  34.91 
 
 		 583 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.607826  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  39.82 
 
 		 580 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4402  ABC transporter related  36.68 
 
 		 584 aa  369  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  35.02 
 
 		 606 aa  372  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  35.76 
 
 		 596 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1150  ATPase  35.94 
 
 		 600 aa  365  2e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.144978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  36.21 
 
 		 593 aa  362  9e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15751  multidrug ABC transporter  36.84 
 
 		 583 aa  362  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0038  ABC-type transport system, ATPase and permease components  39.21 
 
 		 576 aa  360  5e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1309  ATPase  35.95 
 
 		 598 aa  359  7e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.469057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.22 
 
 		 583 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  33.22 
 
 		 589 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.86 
 
 		 583 aa  356  5e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  33.69 
 
 		 583 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  33.69 
 
 		 583 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.04 
 
 		 583 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3976  cyclic nucleotide-binding protein  35.07 
 
 		 574 aa  356  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.69 
 
 		 583 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  35.07 
 
 		 574 aa  356  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0845  multidrug ABC transporter  35.17 
 
 		 581 aa  356  6.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  33.81 
 
 		 577 aa  356  7.999999999999999e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  34.47 
 
 		 584 aa  355  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.51 
 
 		 583 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09061  multidrug ABC transporter  34.46 
 
 		 581 aa  355  1e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.22 
 
 		 583 aa  355  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  33.16 
 
 		 583 aa  354  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  33.51 
 
 		 583 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  34.87 
 
 		 581 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06901  multidrug ABC transporter  35.75 
 
 		 583 aa  353  4e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.780793  normal  0.494245 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  34.41 
 
 		 586 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  34.88 
 
 		 581 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  34.96 
 
 		 581 aa  352  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.88 
 
 		 586 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  34.88 
 
 		 586 aa  351  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0640  ATPase  35.84 
 
 		 588 aa  351  2e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10371  multidrug ABC transporter  34.28 
 
 		 581 aa  351  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.88 
 
 		 586 aa  350  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09041  multidrug ABC transporter  35.25 
 
 		 581 aa  349  6e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  35.06 
 
 		 586 aa  349  7e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.19 
 
 		 548 aa  349  9e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.7 
 
 		 586 aa  349  9e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  34.7 
 
 		 586 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.7 
 
 		 586 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  33.93 
 
 		 577 aa  348  1e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.7 
 
 		 586 aa  348  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  37.72 
 
 		 588 aa  347  3e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  37.99 
 
 		 589 aa  346  8e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  35.71 
 
 		 579 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  33.66 
 
 		 588 aa  344  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2849  ABC transporter related  37.74 
 
 		 595 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104844  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 		 604 aa  343  5e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0484  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  35.92 
 
 		 590 aa  342  9e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0491  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  35.74 
 
 		 590 aa  341  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.961143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  34.19 
 
 		 594 aa  341  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00400  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  35.74 
 
 		 590 aa  340  5e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0525  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  35.74 
 
 		 590 aa  340  5e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0536  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  35.74 
 
 		 590 aa  340  5e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.772204 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3167  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  35.74 
 
 		 590 aa  340  5e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.564857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00404  hypothetical protein  35.74 
 
 		 590 aa  340  5e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>