271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_R0096 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_R0090  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0096  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0081  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0063  tRNA-Pro  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0071  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0135255  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0024  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.158579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0051  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000340535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0097  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000321345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0034  tRNA-Pro  92 
 
 		 78 bp  93.7  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000537169  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0108  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0021  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5733  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0007424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000658436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0861  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000771561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000195724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5812  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000461866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4570  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  normal  0.109465 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0102  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 79 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0027  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0219  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000281593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5640  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 79 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5027  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000593186  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4996  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0786  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.39935e-31 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000933808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5665  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000462002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5695  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000661366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5725  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000708731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 80 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000160288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5043  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5673  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000105967  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-4  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 80 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000117481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0300  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871515  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 80 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0136  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00336688  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000342912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0025  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0259954  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0031  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.942258  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0180  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0052  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0015  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000278716  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0055  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0105  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000482088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0015  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000369215  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0055  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.758534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0025  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0052  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0101  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00179656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0278  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0132  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000929612  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt024  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000181735  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0741  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0573  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.226409  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0012  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.189557  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0044  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0044  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0058  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0297  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000682634  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0563  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1575  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1610  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.815519 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0029  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0173  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.485215  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0034  tRNA-Pro  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000221471  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0010  tRNA-Pro  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0571351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0033  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0057  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000568305  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0061  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000960142  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0037  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09860  tRNA-Pro  88.52 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.513474  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09510  tRNA-Pro  88.52 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.500506  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0068  tRNA-Pro  97.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.147043  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R20  tRNA-Pro  86.57 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0032  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0138154  hitchhiker  0.00000207581 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0042  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0030  tRNA-Pro  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135671  decreased coverage  0.0000000375958 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0023  tRNA-Pro  94.59 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0024  tRNA-Pro  94.59 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0058  tRNA-Pro  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0071  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000628165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0060  tRNA-Pro  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0044  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000299303  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0051  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0006  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0282  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000340373  hitchhiker  0.0000247007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0038  tRNA-Pro  85.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0050  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0050  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0072  tRNA-Pro  91.11 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000117208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0031  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0616283  decreased coverage  0.00565268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>