More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_R0088 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_R0052  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000802106  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0086  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795168  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0081  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0459508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0064  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0088  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  95.77 
 
 		 74 bp  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  95.77 
 
 		 74 bp  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  95.77 
 
 		 74 bp  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0032  tRNA-Gly  95.77 
 
 		 74 bp  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000435638  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0032  tRNA-Gly  95.77 
 
 		 74 bp  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000507298  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0071  tRNA-Gly  95.77 
 
 		 74 bp  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000447795  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0071  tRNA-Gly  95.77 
 
 		 74 bp  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000022788  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0092  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 71 bp  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000423712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0110  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 71 bp  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00109047  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0036  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.048485  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0049  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  0.991667 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0005  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000107449  hitchhiker  0.00000669742 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0054  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.809782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0030  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000137956  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt05  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt05  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0017  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000450697  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0005  tRNA-Gly  92.54 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000162881  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0309  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0017  tRNA-Gly  93.44 
 
 		 71 bp  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.162954  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309344  tRNA-Gly  93.44 
 
 		 71 bp  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309190  tRNA-Gly  93.44 
 
 		 71 bp  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.179054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0050  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0006  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.881169  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt10  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt10  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0043  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000110087  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0005  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0030  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000875234  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0037  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0084  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t06  tRNA-Gly  91.8 
 
 		 71 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000883403  unclonable  0.000000195442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t06  tRNA-Gly  91.8 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.490066  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0018  tRNA-Gly  91.8 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA68  tRNA-Gly  91.8 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000000111768  normal  0.639487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R88  tRNA-Gly  91.8 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0009  tRNA-Gly  91.8 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197964  hitchhiker  0.00000895065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0085  tRNA-Gly  91.8 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000318176  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0015  tRNA-Gly  91.8 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000649804  normal  0.0121052 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1872  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0196085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0003  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0002  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0043  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0944227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0318  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000203347  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0040  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0820  tRNA-Gly  90.16 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0945604  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0068  tRNA-Gly  90.16 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309292  tRNA-Gly  93.88 
 
 		 71 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGlyVIMSS1309123  tRNA-Gly  90.16 
 
 		 71 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.658382  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60030  tRNA-Gly  90.16 
 
 		 71 bp  73.8  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0035  tRNA-Gly  90.16 
 
 		 71 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGlyVIMSS1309072  tRNA-Gly  90.16 
 
 		 71 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGlyVIMSS1309148  tRNA-Gly  90.16 
 
 		 71 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0016  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000070019  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.951593  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0032  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0034  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000457466  normal  0.978086 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2370  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00487087  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0003  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0014  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.030133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0077  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0031  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.271657  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0056  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0032  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.274432  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0040  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.983411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0011  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000624107  normal  0.164759 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0009  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 71 bp  67.9  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0032  tRNA-Gly  90.74 
 
 		 71 bp  67.9  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.598279  normal  0.0388525 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2036  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0078  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555629  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0025  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.458906 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0744  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3118  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0033  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.544366 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1514  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0267785  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3090  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20543  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0061  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.944304  normal  0.76215 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3055  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379519  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0008  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0353733  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0035  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0578114  normal  0.382636 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0025  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.633427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0025  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08660  tRNA-Gly  88.52 
 
 		 71 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000214078  hitchhiker  0.000527439 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2577  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0012  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0024  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0781725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>