148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_R0061 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_R0061  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0103  tRNA-Leu  98.8 
 
 		 83 bp  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0049  tRNA-Leu  98.8 
 
 		 83 bp  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000122389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0050  tRNA-Leu  97.59 
 
 		 86 bp  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000589808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5663  tRNA-Leu  95.18 
 
 		 86 bp  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  95.18 
 
 		 89 bp  133  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  95.18 
 
 		 89 bp  133  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.3138200000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  95.18 
 
 		 89 bp  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  95.18 
 
 		 86 bp  133  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000815391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0276  tRNA-Leu  95.18 
 
 		 86 bp  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5045  tRNA-Leu  95.18 
 
 		 86 bp  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000280343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5671  tRNA-Leu  95.18 
 
 		 86 bp  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000115086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0050  tRNA-Leu  95.18 
 
 		 86 bp  133  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000197413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0298  tRNA-Leu  95.18 
 
 		 86 bp  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000067681  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0072  tRNA-Leu  93.98 
 
 		 86 bp  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000050044  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0072  tRNA-Leu  93.98 
 
 		 86 bp  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000217176  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  111  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0036  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  89.7  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0004  tRNA-Leu  87.95 
 
 		 86 bp  85.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.549944  normal  0.0458093 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0032  tRNA-Leu  97.67 
 
 		 84 bp  69.9  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148891  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0041  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0038  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00225863  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0053  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406818  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0057  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000872679  normal  0.444657 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0048  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0012  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.898265 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0041  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0841981  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0020  tRNA-Leu  87.72 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424906  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3045  hypothetical protein  94.44 
 
 		 98 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt43  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt43  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0037  tRNA-Leu  95 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507669  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0058  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0025  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316898  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0038  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000434442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0056  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1968  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0025  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.873101  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17070  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.779723 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0030  tRNA-Leu  84.34 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2521  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000206835  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0033  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34016  normal  0.730319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0032  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000233164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0028  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.639598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0034  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0027  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.994542  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0021  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763911  hitchhiker  0.00000000000407532 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0052  tRNA-Leu  89.09 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129877  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0044  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00489579  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0036  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000019352  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0040  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0360515  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0036  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0619619  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0008  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0024  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0031  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0989322 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0029  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1753  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0142  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0162702  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1796  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0107643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1814  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0024  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1024  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00686094  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0067  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.07892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0068  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.46503  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0036  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0035  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13650  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00181798  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14022  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0037  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0612357  normal  0.0343105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0037  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0041  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  0.0670034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0042  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00515288  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0043  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0955991  normal  0.0560674 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0039  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126939  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21100  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21120  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.387136  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0040  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00145069  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0030  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0057  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0058  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.031722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0017  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0028  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380759  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1054  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0011771  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0946  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1797  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0101943  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0017  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000414228  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0019  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.531024  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0009  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000126286  hitchhiker  0.0000000180291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0009  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0015  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0036  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0052  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0598  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0052  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>