More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3567 on replicon NC_013412
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013412  GYMC61_3567  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 
477 aa  984    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  69.03 
 
 
471 aa  661    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3609  isopropylmalate isomerase large subunit  65.38 
 
 
466 aa  634    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  68.82 
 
 
471 aa  672    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  66.31 
 
 
469 aa  656    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0630  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  65.6 
 
 
466 aa  640    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0592  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  65.81 
 
 
466 aa  640    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  65.59 
 
 
466 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  65.59 
 
 
466 aa  632  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  65.38 
 
 
466 aa  632  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  65.59 
 
 
466 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  66.88 
 
 
465 aa  632  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  65.38 
 
 
466 aa  632  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  65.59 
 
 
466 aa  632  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3797  isopropylmalate isomerase large subunit  65.17 
 
 
466 aa  634  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  65.59 
 
 
466 aa  632  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0075  isopropylmalate isomerase large subunit  65.38 
 
 
466 aa  629  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  64.59 
 
 
476 aa  630  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0413  isopropylmalate isomerase large subunit  64.87 
 
 
468 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0079  isopropylmalate isomerase large subunit  65.38 
 
 
466 aa  629  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0387  isopropylmalate isomerase large subunit  65.09 
 
 
468 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0473  isopropylmalate isomerase large subunit  65.09 
 
 
474 aa  630  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2916  isopropylmalate isomerase large subunit  64.16 
 
 
470 aa  628  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0278  isopropylmalate isomerase large subunit  63.7 
 
 
469 aa  630  1e-179  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2938  isopropylmalate isomerase large subunit  64.59 
 
 
476 aa  630  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  64.59 
 
 
476 aa  630  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0399  isopropylmalate isomerase large subunit  65.09 
 
 
468 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573464 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3586  isopropylmalate isomerase large subunit  64.73 
 
 
474 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  64.95 
 
 
474 aa  627  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.134544 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0337  isopropylmalate isomerase large subunit  64.3 
 
 
470 aa  625  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.301995  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0127  isopropylmalate isomerase large subunit  64.95 
 
 
466 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0123  isopropylmalate isomerase large subunit  64.95 
 
 
466 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.713431 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  64.95 
 
 
466 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0620  isopropylmalate isomerase large subunit  64.52 
 
 
466 aa  621  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0122  isopropylmalate isomerase large subunit  64.95 
 
 
466 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.160243 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0388  isopropylmalate isomerase large subunit  64.44 
 
 
468 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  63.4 
 
 
472 aa  624  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0127  isopropylmalate isomerase large subunit  64.95 
 
 
466 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.03719 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4234  isopropylmalate isomerase large subunit  63.66 
 
 
474 aa  618  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3470  isopropylmalate isomerase large subunit  63.52 
 
 
466 aa  618  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  0.406012 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4999  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  63.77 
 
 
470 aa  619  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653294  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0743  isopropylmalate isomerase large subunit  65.59 
 
 
466 aa  620  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  65.08 
 
 
465 aa  618  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2802  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  65.08 
 
 
462 aa  621  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal  0.228539 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0370  isopropylmalate isomerase large subunit  64.5 
 
 
474 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001658  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  62.18 
 
 
466 aa  615  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00815  isopropylmalate isomerase large subunit  62.39 
 
 
466 aa  615  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09060  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  64.63 
 
 
471 aa  616  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918212  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3550  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  63.83 
 
 
456 aa  614  9.999999999999999e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0395  isopropylmalate isomerase large subunit  63.09 
 
 
466 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13003  isopropylmalate isomerase large subunit  63.4 
 
 
473 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4227  isopropylmalate isomerase large subunit  63.93 
 
 
481 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.888543 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1591  isopropylmalate isomerase large subunit  64.92 
 
 
473 aa  611  9.999999999999999e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.777227 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03087  isopropylmalate isomerase large subunit  62.39 
 
 
466 aa  609  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4210  isopropylmalate isomerase large subunit  60.78 
 
 
471 aa  610  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.19 
 
 
473 aa  610  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3826  isopropylmalate isomerase large subunit  62.45 
 
 
466 aa  608  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3818  isopropylmalate isomerase large subunit  63.58 
 
 
470 aa  608  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2225  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  66.95 
 
 
471 aa  608  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.918253  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2135  isopropylmalate isomerase large subunit  63.5 
 
 
481 aa  609  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0422  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  62.95 
 
 
471 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2067  isopropylmalate isomerase large subunit  63.66 
 
 
467 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  64.3 
 
 
470 aa  605  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08740  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.8 
 
 
484 aa  607  9.999999999999999e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000460564  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4548  isopropylmalate isomerase large subunit  62.23 
 
 
466 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.182173  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3298  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  63.12 
 
 
471 aa  606  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405916  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2164  isopropylmalate isomerase large subunit  62.96 
 
 
479 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2145  isopropylmalate isomerase large subunit  63.38 
 
 
469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  64.32 
 
 
469 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0947  isopropylmalate isomerase large subunit  63.46 
 
 
469 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4084  isopropylmalate isomerase large subunit  64.1 
 
 
469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774814  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1990  isopropylmalate isomerase large subunit  63.17 
 
 
469 aa  598  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.508129  normal  0.146532 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1729  isopropylmalate isomerase large subunit  62.74 
 
 
469 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.405505  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  63.6 
 
 
469 aa  600  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2314  isopropylmalate isomerase large subunit  62.53 
 
 
469 aa  600  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0778  isopropylmalate isomerase large subunit  62.74 
 
 
479 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000809283  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4630  isopropylmalate isomerase large subunit  62.96 
 
 
477 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1901  isopropylmalate isomerase large subunit  61.77 
 
 
481 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8018  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.61 
 
 
459 aa  598  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0672  isopropylmalate isomerase large subunit  62.53 
 
 
469 aa  598  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00206744  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1641  isopropylmalate isomerase large subunit  62.74 
 
 
469 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  63.25 
 
 
469 aa  598  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  62.8 
 
 
468 aa  599  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0336  isopropylmalate isomerase large subunit  62.07 
 
 
482 aa  600  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  63.52 
 
 
470 aa  600  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1821  isopropylmalate isomerase large subunit  63.17 
 
 
469 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626663  normal  0.539563 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1921  isopropylmalate isomerase large subunit  61.77 
 
 
481 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0375  isopropylmalate isomerase large subunit  61.34 
 
 
471 aa  600  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1849  isopropylmalate isomerase large subunit  62.74 
 
 
469 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0604506  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2454  isopropylmalate isomerase large subunit  62.74 
 
 
469 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0296584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2316  isopropylmalate isomerase large subunit  62.74 
 
 
469 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0520  isopropylmalate isomerase large subunit  62.74 
 
 
469 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.643053  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1967  isopropylmalate isomerase large subunit  61.77 
 
 
481 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  63.68 
 
 
469 aa  596  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3579  isopropylmalate isomerase large subunit  62.31 
 
 
469 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.482085  normal  0.399315 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2256  isopropylmalate isomerase large subunit  62.07 
 
 
484 aa  597  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000783708 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1149  isopropylmalate isomerase large subunit  61.49 
 
 
481 aa  595  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000597548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3621  isopropylmalate isomerase large subunit  62.47 
 
 
465 aa  597  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2889  isopropylmalate isomerase large subunit  62.96 
 
 
469 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3215  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.75 
 
 
477 aa  595  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.056695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>