217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3561 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  100 
 
 		 121 aa  246  7e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  82.52 
 
 		 116 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  73.39 
 
 		 115 aa  169  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  73.39 
 
 		 115 aa  168  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  72.48 
 
 		 119 aa  167  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  72.48 
 
 		 119 aa  167  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  72.48 
 
 		 119 aa  167  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  72.48 
 
 		 119 aa  167  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  72.48 
 
 		 119 aa  167  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  72.48 
 
 		 115 aa  167  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  72.48 
 
 		 115 aa  166  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  71.56 
 
 		 115 aa  165  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  72.48 
 
 		 115 aa  164  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  54.72 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  54.13 
 
 		 109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  52.83 
 
 		 117 aa  114  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  52.83 
 
 		 117 aa  114  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  48.65 
 
 		 117 aa  113  7.999999999999999e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  48.11 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  51.4 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  49.14 
 
 		 116 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  49.07 
 
 		 117 aa  104  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  42.06 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  41.59 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  43.93 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  40.62 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  38.32 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  34.17 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  34.17 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  42.86 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  37.61 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  36.54 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  38.38 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  34.86 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  44.83 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  34.23 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  35.78 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  36.97 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  38 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  31.19 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  34.82 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  34.23 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  30.63 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  30.63 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  33.64 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  30.63 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  33.94 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  35.96 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  31.78 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0983  ribonuclease P protein component  34.58 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  36.56 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  33.64 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1040  ribonuclease P protein component  33.64 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0513155  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  35.78 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  33.01 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  40.22 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  32.23 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  36.56 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  36.56 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03486  ribonuclease P protein component  37.66 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  34.45 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  32.73 
 
 		 110 aa  57  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0552  ribonuclease P protein component  34.91 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  33.62 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  40.74 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  40.74 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  37.21 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2315  ribonuclease P  33.33 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  40.22 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  31.82 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  36.67 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  36.05 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  33.64 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  32.32 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2225  ribonuclease P  33.33 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  35 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  34.65 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  37.84 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  29.91 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2237  ribonuclease P protein component  37.37 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  31.5 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  34.95 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  39.47 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1829  ribonuclease P protein component  40.85 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  36.94 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  38.16 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  29.55 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  37.21 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  31.67 
 
 		 120 aa  52.8  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  33.03 
 
 		 119 aa  52.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0552  ribonuclease P protein component  34.52 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0650  ribonuclease P protein component (RNaseP protein) (RNaseP protein) (protein C5)  37.5 
 
 		 69 aa  52  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.963199  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  33.04 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  29.41 
 
 		 130 aa  52  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  26.09 
 
 		 127 aa  52  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  33.05 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  34.91 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  31.82 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>