More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3555 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 		 238 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  77.73 
 
 		 238 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  68.07 
 
 		 239 aa  353  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  68.07 
 
 		 239 aa  353  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  67.65 
 
 		 239 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  67.65 
 
 		 239 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  67.65 
 
 		 239 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  67.65 
 
 		 239 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  67.65 
 
 		 239 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  67.65 
 
 		 239 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  67.65 
 
 		 239 aa  351  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  68.07 
 
 		 239 aa  350  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  67.65 
 
 		 239 aa  333  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  62.88 
 
 		 239 aa  307  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  62.88 
 
 		 239 aa  307  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  61.14 
 
 		 239 aa  302  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  58.51 
 
 		 241 aa  279  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  50.21 
 
 		 239 aa  246  2e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  51.46 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  51.26 
 
 		 237 aa  245  4e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  50.21 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  45.25 
 
 		 241 aa  219  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  49.37 
 
 		 239 aa  218  6e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  47.35 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  44.59 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  47.77 
 
 		 239 aa  208  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  47.46 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  44.93 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  44.64 
 
 		 238 aa  195  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  40.97 
 
 		 240 aa  194  9e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  45.78 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  42.86 
 
 		 242 aa  192  5e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  40.44 
 
 		 239 aa  191  7e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  41.48 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  40 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  44.2 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  41.88 
 
 		 235 aa  181  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  42.11 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  39.66 
 
 		 236 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  41.78 
 
 		 210 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  41.2 
 
 		 253 aa  171  9e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  39 
 
 		 240 aa  169  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2335  16S rRNA methyltransferase GidB  38.64 
 
 		 245 aa  168  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  39.19 
 
 		 244 aa  167  9e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  39.73 
 
 		 240 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3051  methyltransferase GidB  40.28 
 
 		 242 aa  166  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.014233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  38.6 
 
 		 240 aa  164  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  38.6 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  33.47 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  36.97 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0267  16S rRNA methyltransferase GidB  37.96 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  35.74 
 
 		 241 aa  150  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  35.91 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  36.32 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  40.54 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  37.55 
 
 		 239 aa  148  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3772  16S rRNA methyltransferase GidB  34.25 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494361  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0878  methyltransferase GidB  37.04 
 
 		 243 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  36.16 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  34.91 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  34.8 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  33.18 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2128  methyltransferase GidB  33.18 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3211  methyltransferase GidB  37.75 
 
 		 261 aa  138  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  37.13 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  36.29 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  36.16 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3620  methyltransferase GidB  36.74 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  31.78 
 
 		 251 aa  131  7.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1364  methyltransferase GidB  35.04 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15951  16S rRNA methyltransferase GidB  32.06 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16651  putative glucose inhibited division protein B  32.05 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  35.51 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  36.89 
 
 		 217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  36.41 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16771  putative glucose inhibited division protein B  31.62 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1568  methyltransferase GidB  31.06 
 
 		 237 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.975144  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  33.82 
 
 		 219 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0044  16S rRNA methyltransferase GidB  33.93 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3558  glucose inhibited division protein  34.13 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4009  methyltransferase GidB  33.5 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00213525  hitchhiker  0.00000000363002 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1192  methyltransferase GidB  36.74 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0331382  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0617  16S rRNA methyltransferase GidB  33.63 
 
 		 243 aa  118  6e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  35.68 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  34.04 
 
 		 215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3463  glucose-inhibited division protein B  34.31 
 
 		 217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  33.19 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  30.41 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  32.38 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  32.11 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  34.29 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0318  16S rRNA methyltransferase GidB  33.52 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.309267  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2055  16S rRNA methyltransferase GidB  33.64 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.460763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04501  16S rRNA methyltransferase GidB  31.39 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  33.81 
 
 		 214 aa  109  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0013  methyltransferase GidB  30.41 
 
 		 222 aa  108  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119734  hitchhiker  0.00444257 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  32.09 
 
 		 211 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00432  16S rRNA methyltransferase GidB  32.72 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  38.1 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  29.95 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>