More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3546 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 95 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  90.53 
 
 		 95 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  75.79 
 
 		 95 aa  150  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  69.47 
 
 		 96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  69.47 
 
 		 96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  69.47 
 
 		 96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  69.47 
 
 		 96 aa  138  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  68.42 
 
 		 96 aa  137  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  68.42 
 
 		 96 aa  137  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  68.42 
 
 		 96 aa  137  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  68.42 
 
 		 96 aa  137  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  68.42 
 
 		 96 aa  137  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  68.42 
 
 		 96 aa  137  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  58.33 
 
 		 98 aa  120  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  58.33 
 
 		 98 aa  120  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  55.91 
 
 		 96 aa  114  6e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  53.12 
 
 		 98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  56.99 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  52.69 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  56.25 
 
 		 97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  55.43 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0007  30S ribosomal protein S6  51.09 
 
 		 98 aa  107  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  48.42 
 
 		 95 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  46.32 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  43.62 
 
 		 94 aa  104  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  45.26 
 
 		 95 aa  103  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  46.32 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  46.32 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  46.81 
 
 		 96 aa  99.8  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  49.45 
 
 		 98 aa  99.8  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  44.21 
 
 		 94 aa  94  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  38.04 
 
 		 97 aa  87  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  43.96 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  39.78 
 
 		 93 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 97 aa  84  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 		 96 aa  84  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  41.11 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 101 aa  82.8  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  40.22 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 101 aa  80.1  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  38.3 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7039  ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  36.17 
 
 		 96 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0337  ribosomal protein S6  39 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  31.91 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  37.36 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 125 aa  76.6  0.00000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4339  ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>