18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3536 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3536  YycH family protein  100 
 
 
442 aa  908    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3407  YycH family protein  66.15 
 
 
449 aa  655    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5257  YycH family protein  34.68 
 
 
443 aa  249  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5161  hypothetical protein  34.66 
 
 
438 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5648  YycH protein  34.22 
 
 
438 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5613  YycH protein  34 
 
 
440 aa  234  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5145  hypothetical protein  33.77 
 
 
438 aa  230  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5348  YycH protein  34.45 
 
 
438 aa  230  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000246614  hitchhiker  0.0000000000000557991 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5570  YycH protein  33.77 
 
 
440 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35171e-33 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5713  hypothetical protein  33.77 
 
 
438 aa  230  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5317  YycH protein  33.77 
 
 
438 aa  230  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5587  YycH protein  33.93 
 
 
438 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.825694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4004  YycH family protein  31.4 
 
 
446 aa  224  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.930687  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0020  hypothetical protein  22.02 
 
 
444 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2532  yycH protein  20.44 
 
 
445 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0020  hypothetical protein  21.18 
 
 
392 aa  89.7  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0021  YycH family protein  23.08 
 
 
431 aa  82  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0066  hypothetical protein  22.66 
 
 
474 aa  49.7  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000449157  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>