88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3485 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 		 127 aa  247  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  52.53 
 
 		 111 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  50.41 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  50.43 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  46.02 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  49.12 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  48.7 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  50.52 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  47.22 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  41.8 
 
 		 126 aa  100  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  46.55 
 
 		 130 aa  100  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  45 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  35.83 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  38.98 
 
 		 142 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  41.94 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  33.33 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  41.84 
 
 		 386 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  43.9 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  51.58 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  40.35 
 
 		 386 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  40 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  42.74 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  42.74 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  47.22 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  44.76 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  37.39 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3301  hypothetical protein  53.45 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  36.89 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  55.07 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2654  protein of unknown function DUF1232  52.59 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0560  hypothetical protein  52.63 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  42.98 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  47.78 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  50.62 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  36.59 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  40.45 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  43.18 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1449  hypothetical protein  50.62 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.808576  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  46.75 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  35.71 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  39.33 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  34.69 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  34.44 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  32.89 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  36.14 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  41.05 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  34.72 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2183  hypothetical protein  38.81 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  34.72 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  31.71 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  35.42 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  39.02 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  35.62 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0363  hypothetical protein  38.71 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  28.87 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  28.92 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  33.9 
 
 		 249 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  28.05 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  27.84 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  34.48 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  59.38 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  35.59 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  27.91 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  25.71 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  40 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  30 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  26.42 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  32.81 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  30.56 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0277  protein of unknown function DUF1232  26.04 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4982  hypothetical protein  26.73 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4687  hypothetical protein  26.73 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.938397 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  44.44 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4599  hypothetical protein  26.73 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  32.31 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  32.73 
 
 		 167 aa  40.8  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  25.76 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  32.31 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  32.31 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  32.31 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  25.76 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  32.31 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  30.91 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  32.31 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0904  hypothetical protein  47.37 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  48.78 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0801  hypothetical protein  35.94 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  58.06 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>