More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3462 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  58.36 
 
 		 683 aa  796    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  58.51 
 
 		 683 aa  797    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  58.67 
 
 		 683 aa  795    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  58.82 
 
 		 683 aa  801    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  58.01 
 
 		 683 aa  811    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  58.67 
 
 		 683 aa  797    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  58.51 
 
 		 683 aa  796    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  58.98 
 
 		 683 aa  803    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  58.82 
 
 		 683 aa  801    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  58.67 
 
 		 683 aa  795    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  58.41 
 
 		 683 aa  796    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  77.16 
 
 		 683 aa  1071    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 681 aa  1412    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2797  penicillin-binding protein, 1A family  40.98 
 
 		 677 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  39.63 
 
 		 649 aa  434  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  39.34 
 
 		 648 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  41.51 
 
 		 661 aa  425  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  36.7 
 
 		 668 aa  415  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  40.35 
 
 		 618 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  40.42 
 
 		 643 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  40.42 
 
 		 643 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  37.6 
 
 		 643 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  36.06 
 
 		 705 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  39.83 
 
 		 640 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  39.07 
 
 		 693 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  37.32 
 
 		 648 aa  387  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  38 
 
 		 667 aa  379  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  36.64 
 
 		 701 aa  376  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  38.07 
 
 		 744 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  35.86 
 
 		 806 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  39.83 
 
 		 656 aa  378  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  39.48 
 
 		 905 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  37.21 
 
 		 829 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  38.99 
 
 		 640 aa  373  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  36.64 
 
 		 761 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  37.17 
 
 		 704 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  38.06 
 
 		 654 aa  373  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  37.35 
 
 		 662 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  36.71 
 
 		 811 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  37.3 
 
 		 646 aa  369  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  37.01 
 
 		 625 aa  365  1e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  40.24 
 
 		 712 aa  361  2e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  39.79 
 
 		 626 aa  360  4e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  38.65 
 
 		 824 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  34.07 
 
 		 795 aa  358  1.9999999999999998e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  38.49 
 
 		 824 aa  356  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  39.2 
 
 		 714 aa  353  8e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  35.81 
 
 		 814 aa  352  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  38.55 
 
 		 734 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  39.97 
 
 		 739 aa  352  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  39 
 
 		 714 aa  350  6e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  36.18 
 
 		 776 aa  349  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  36.65 
 
 		 765 aa  349  1e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  37.46 
 
 		 728 aa  348  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  37.29 
 
 		 727 aa  347  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  37.29 
 
 		 727 aa  347  6e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  35.41 
 
 		 676 aa  346  1e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  38.95 
 
 		 761 aa  345  1e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  38.22 
 
 		 728 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  35.75 
 
 		 779 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  39.25 
 
 		 678 aa  341  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  39.03 
 
 		 720 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  36.27 
 
 		 757 aa  340  4e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  36.92 
 
 		 751 aa  340  5e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  37.29 
 
 		 710 aa  338  9.999999999999999e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  36.92 
 
 		 691 aa  338  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  39.16 
 
 		 735 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  37.22 
 
 		 732 aa  336  7e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  35.03 
 
 		 880 aa  336  7e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  33.98 
 
 		 665 aa  335  2e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  35.6 
 
 		 860 aa  334  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  37.03 
 
 		 890 aa  334  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  39.19 
 
 		 757 aa  334  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  37.25 
 
 		 853 aa  333  5e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  39.14 
 
 		 833 aa  333  6e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  39.06 
 
 		 712 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0163  1A family penicillin-binding protein  32.45 
 
 		 713 aa  333  9e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  37.63 
 
 		 710 aa  332  1e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  37.92 
 
 		 686 aa  332  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  37.9 
 
 		 709 aa  331  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  38.05 
 
 		 720 aa  330  5.0000000000000004e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  39.58 
 
 		 734 aa  330  6e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  35.62 
 
 		 861 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  36.9 
 
 		 732 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  36.42 
 
 		 741 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  36.29 
 
 		 770 aa  327  6e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  36.35 
 
 		 776 aa  326  7e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  36.32 
 
 		 658 aa  326  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  37.5 
 
 		 658 aa  325  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  39.33 
 
 		 712 aa  323  5e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  35.53 
 
 		 743 aa  323  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  35.53 
 
 		 743 aa  323  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  36.06 
 
 		 824 aa  323  7e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  36.47 
 
 		 680 aa  323  7e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  37.61 
 
 		 651 aa  323  9.000000000000001e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  37.5 
 
 		 952 aa  322  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  35.22 
 
 		 743 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  35.65 
 
 		 730 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1672  penicillin-binding protein, putative  34.5 
 
 		 759 aa  321  3e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 		 846 aa  321  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>