More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3438 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  100 
 
 
66 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3328  50S ribosomal protein L31  95.45 
 
 
66 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  72.31 
 
 
66 aa  102  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2179  50S ribosomal protein L31  69.7 
 
 
82 aa  100  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00985809  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  66.67 
 
 
71 aa  100  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2469  50S ribosomal protein L31  69.7 
 
 
68 aa  100  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  63.08 
 
 
65 aa  98.2  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 
66 aa  98.2  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  64.06 
 
 
73 aa  97.8  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  63.08 
 
 
69 aa  97.4  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  66.67 
 
 
66 aa  96.3  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  66.67 
 
 
66 aa  96.3  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  61.9 
 
 
76 aa  95.5  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 
72 aa  95.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1068  50S ribosomal protein L31  66.67 
 
 
69 aa  94  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.113765  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  56.92 
 
 
70 aa  94  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 
65 aa  93.6  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18000  ribosomal protein L31  60 
 
 
68 aa  93.6  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000315531  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 
73 aa  93.6  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0062  ribosomal protein L31  59.09 
 
 
68 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000350095  hitchhiker  0.00194298 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  62.5 
 
 
66 aa  92  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  63.64 
 
 
66 aa  90.5  6e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3172  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 
66 aa  90.9  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  63.64 
 
 
66 aa  90.5  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 
65 aa  90.1  9e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2399  ribosomal protein L31  62.12 
 
 
67 aa  89.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00761276  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 
66 aa  89.7  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  56.25 
 
 
66 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 
67 aa  89.4  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  53.12 
 
 
74 aa  89.4  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  59.7 
 
 
69 aa  88.2  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141122  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 
66 aa  88.6  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 
75 aa  88.2  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143362  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1117  ribosomal protein L31  56.25 
 
 
153 aa  88.2  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000320944  hitchhiker  0.000000000000256974 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04660  ribosomal protein L31  60.94 
 
 
144 aa  88.2  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  hitchhiker  0.0000489926 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0604  50S ribosomal protein L31P  58.46 
 
 
71 aa  87.8  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  60 
 
 
79 aa  87.8  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 
66 aa  87.8  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  60 
 
 
79 aa  87.8  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2156  ribosomal protein L31  56.92 
 
 
67 aa  87.4  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000333298  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  60.61 
 
 
67 aa  87.4  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2744  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 
72 aa  87.4  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  57.35 
 
 
68 aa  87.4  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  56.25 
 
 
121 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0828  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 
66 aa  87  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 
74 aa  86.7  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4835  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 
65 aa  86.3  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  60 
 
 
67 aa  86.3  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0061  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 
66 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000149068  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  54.69 
 
 
175 aa  86.7  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 
75 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  54.69 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0801  ribosomal protein L31  58.46 
 
 
68 aa  85.5  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000158788  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  55.22 
 
 
67 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  54.69 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 
75 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  52.24 
 
 
68 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  57.58 
 
 
75 aa  84.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0411  ribosomal protein L31  55.38 
 
 
70 aa  85.1  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113411  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  56.72 
 
 
67 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  57.81 
 
 
115 aa  84.7  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1138  50S ribosomal protein L31  53.73 
 
 
68 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1327  50S ribosomal protein L31  53.73 
 
 
68 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00511873  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  54.55 
 
 
73 aa  84.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1109  ribosomal protein L31  53.73 
 
 
68 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000439538  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1235  ribosomal protein L31  57.58 
 
 
76 aa  84.3  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.803826  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6576  ribosomal protein L31  55.74 
 
 
70 aa  84.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 
72 aa  84.3  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0659  ribosomal protein L31  53.85 
 
 
68 aa  84  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1910  50S ribosomal protein L31  53.12 
 
 
66 aa  84  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2792  ribosomal protein L31  58.46 
 
 
69 aa  84  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  55.22 
 
 
75 aa  84  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0808  ribosomal protein L31  53.85 
 
 
68 aa  84  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  53.12 
 
 
120 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0751  ribosomal protein L31  55.22 
 
 
67 aa  83.6  8e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224583  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  55.38 
 
 
69 aa  83.6  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0114  ribosomal protein L31  51.56 
 
 
139 aa  83.6  9e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.434874  normal  0.146385 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 
72 aa  83.6  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 
69 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5423  50S ribosomal protein L31 type B  53.09 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.27581e-63 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5180  50S ribosomal protein L31 type B  53.09 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00675998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5015  50S ribosomal protein L31 type B  53.09 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.65969e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5031  50S ribosomal protein L31 type B  53.09 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000768356  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  53.73 
 
 
70 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5574  50S ribosomal protein L31 type B  53.09 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000588465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5454  50S ribosomal protein L31 type B  53.09 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000123612  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 
74 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5509  50S ribosomal protein L31 type B  51.85 
 
 
81 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5458  50S ribosomal protein L31 type B  51.85 
 
 
81 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128579  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  51.52 
 
 
77 aa  81.6  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  47.76 
 
 
71 aa  81.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3852  50S ribosomal protein L31 type B  51.85 
 
 
81 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000664047  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5498  50S ribosomal protein L31 type B  51.85 
 
 
81 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000131175  unclonable  2.48072e-26 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4098  50S ribosomal protein L31  50 
 
 
71 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  53.73 
 
 
75 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3811  50S ribosomal protein L31  50 
 
 
71 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0118  50S ribosomal protein L31  50 
 
 
71 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2252  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 
72 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200856  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3888  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>