More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3435 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3435  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 358 aa  731    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  93.82 
 
 		 358 aa  669    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  81.07 
 
 		 355 aa  608  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  79.66 
 
 		 355 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  79.38 
 
 		 358 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  79.38 
 
 		 358 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  79.38 
 
 		 358 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  79.38 
 
 		 358 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  79.66 
 
 		 355 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  79.38 
 
 		 358 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  79.38 
 
 		 358 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  79.66 
 
 		 358 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  79.38 
 
 		 355 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  65.55 
 
 		 358 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  65.55 
 
 		 358 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  64.43 
 
 		 358 aa  483  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  64.67 
 
 		 356 aa  480  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  64.39 
 
 		 355 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  63.53 
 
 		 356 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  62.71 
 
 		 357 aa  472  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2780  peptide chain release factor 1  68.95 
 
 		 356 aa  474  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.014775  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  60.62 
 
 		 362 aa  460  9.999999999999999e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  63.25 
 
 		 355 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  59.83 
 
 		 359 aa  456  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  59.27 
 
 		 359 aa  448  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  58.97 
 
 		 360 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  58.97 
 
 		 360 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  59.15 
 
 		 355 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  58.99 
 
 		 359 aa  441  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  62.11 
 
 		 355 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  58.36 
 
 		 355 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  56.3 
 
 		 359 aa  438  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0610  peptide chain release factor 1  58.15 
 
 		 357 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0746132  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  58.57 
 
 		 362 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  60.78 
 
 		 360 aa  436  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  58.94 
 
 		 356 aa  436  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  58.31 
 
 		 355 aa  436  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  59.04 
 
 		 367 aa  429  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  57.39 
 
 		 357 aa  430  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  62.25 
 
 		 356 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  58.69 
 
 		 355 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  59.55 
 
 		 358 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  57.71 
 
 		 361 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  57.55 
 
 		 356 aa  420  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  57.91 
 
 		 361 aa  417  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  55.56 
 
 		 356 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  62.32 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  56.18 
 
 		 358 aa  412  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  57.79 
 
 		 358 aa  413  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2449  peptide chain release factor 1  58.92 
 
 		 359 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  55.93 
 
 		 355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0144  peptide chain release factor 1  55.71 
 
 		 363 aa  404  1e-111  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2868  peptide chain release factor 1  54.93 
 
 		 364 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1582  peptide chain release factor 1  53.52 
 
 		 357 aa  402  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2429  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 364 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0447766  normal  0.0852947 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  54.68 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  55.85 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  55.21 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  53.54 
 
 		 363 aa  399  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_993  peptide chain release factor 1  54.13 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.394955  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0615  peptide chain release factor 1  57.14 
 
 		 358 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  52.54 
 
 		 359 aa  400  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 356 aa  400  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1210  peptide chain release factor 1  52.99 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 		 361 aa  396  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1784  peptide chain release factor 1  55.9 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.404701  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl634  peptide chain release factor 1  53.85 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  53.95 
 
 		 353 aa  395  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  56.74 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  55.17 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2029  peptide chain release factor 1  54.06 
 
 		 358 aa  397  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1599  peptide chain release factor 1  55.34 
 
 		 355 aa  394  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1020  peptide chain release factor 1  53.28 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  54.73 
 
 		 360 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  54.99 
 
 		 356 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  52.96 
 
 		 370 aa  388  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  54.19 
 
 		 355 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  53.5 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2796  peptide chain release factor 1  54.24 
 
 		 365 aa  391  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000135616  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  52.79 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  53.41 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  56.37 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  53.11 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1966  peptide chain release factor 1  55.06 
 
 		 355 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  52.96 
 
 		 370 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  52.86 
 
 		 363 aa  390  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  53.91 
 
 		 355 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  54.52 
 
 		 361 aa  388  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  53.24 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  52.68 
 
 		 370 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  54.09 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  53.11 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  54.09 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  54.44 
 
 		 361 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  55.06 
 
 		 355 aa  388  1e-106  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  53.82 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  52.84 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0790  peptide chain release factor 1  52.72 
 
 		 362 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  53.07 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  53.22 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0384277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>