114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3431 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3431  protein of unknown function DUF204  100 
 
 
183 aa  341  4e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3318  protein of unknown function DUF204  73.08 
 
 
184 aa  249  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.861513  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3845  hypothetical protein  58.43 
 
 
181 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000297059  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5451  hypothetical protein  55.68 
 
 
182 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5008  integral membrane protein  55.68 
 
 
182 aa  193  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0149055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5024  integral membrane protein  55.68 
 
 
182 aa  192  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5502  hypothetical protein  55.68 
 
 
182 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000153104  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5447  hypothetical protein  54.55 
 
 
182 aa  191  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00491428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5173  hypothetical protein  55.11 
 
 
182 aa  191  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124762  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5567  hypothetical protein  55.11 
 
 
182 aa  191  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000345667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5416  hypothetical protein  55.11 
 
 
182 aa  191  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5505  hypothetical protein  54.55 
 
 
182 aa  190  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000039704  unclonable  3.9395e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5122  hypothetical protein  56.25 
 
 
182 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4180  protein of unknown function DUF204  37.85 
 
 
181 aa  110  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000492866  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4830  protein of unknown function DUF204  37.1 
 
 
195 aa  98.6  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0117076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0431  hypothetical protein  32.96 
 
 
182 aa  95.5  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608488  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3165  hypothetical protein  40.34 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000676254  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2771  protein of unknown function DUF204  36.99 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2150  hypothetical protein  36.78 
 
 
180 aa  87.8  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2394  hypothetical protein  33.9 
 
 
195 aa  85.1  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0649819  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2394  hypothetical protein  40.53 
 
 
194 aa  84.7  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.119245 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17940  predicted membrane protein  34.59 
 
 
190 aa  84  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2070  hypothetical protein  36.08 
 
 
188 aa  82  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000608383  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0068  protein of unknown function DUF204  35.96 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.132326  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0065  protein of unknown function DUF204  38.16 
 
 
181 aa  80.9  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00032233  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0455  hypothetical protein  32.77 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.703448 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01791  conserved inner membrane protein  31.32 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000275472  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1822  protein of unknown function DUF204  31.32 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1911  hypothetical protein  31.32 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166044  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2050  hypothetical protein  31.32 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1811  hypothetical protein  31.32 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035153  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1366  hypothetical protein  31.32 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000222622  normal  0.0184788 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2088  hypothetical protein  31.32 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111578  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2553  hypothetical protein  31.32 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000161529  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01779  hypothetical protein  31.32 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2522  protein of unknown function DUF204  32.43 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0555852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1700  protein of unknown function DUF204  31.54 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000050274  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1979  protein of unknown function DUF204  31.25 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0850567  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1799  protein of unknown function DUF204  35.59 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.971603 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1974  membrane protein YebN  30.73 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal  0.466937 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2035  membrane protein YebN  30.73 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.452254  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1978  membrane protein YebN  30.73 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1297  membrane protein YebN  30.73 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00128571  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1481  membrane protein YebN  30.73 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4096  hypothetical protein  31.82 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2187  protein of unknown function DUF204  27.37 
 
 
189 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3755  hypothetical protein  30.56 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0559  protein of unknown function DUF204  29.21 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.179338  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2322  protein of unknown function DUF204  31.87 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2215  protein of unknown function DUF204  27.84 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000652284  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3406  protein of unknown function DUF204  33.52 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000037692  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1922  hypothetical protein  27.84 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0107711  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2390  hypothetical protein  30.12 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0400913  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0607  hypothetical protein  29.34 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.686733 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2025  protein of unknown function DUF204  28.41 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.331767  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3288  hypothetical protein  31.69 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00723105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1273  protein of unknown function DUF204  31.41 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3146  hypothetical protein  27.93 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.120632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1725  hypothetical protein  29.24 
 
 
178 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.113656  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1699  protein of unknown function DUF204  29.19 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.853895  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1339  hypothetical protein  29.93 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02440  predicted membrane protein  31.82 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.307428  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2817  hypothetical protein  28.16 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000019593 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4397  hypothetical protein  30.11 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1531  hypothetical protein  31.84 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000880885  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0221  hypothetical protein  29.65 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1134  hypothetical protein  29.31 
 
 
193 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000076644  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2978  hypothetical protein  30.49 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0770545  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6717  protein of unknown function DUF204  28.09 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704684  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2453  protein of unknown function DUF204  25.7 
 
 
187 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3656  protein of unknown function DUF204  25.7 
 
 
187 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00251893  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0162  hypothetical protein  27.33 
 
 
187 aa  62.4  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0202  hypothetical protein  27.33 
 
 
187 aa  62.4  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2102  protein of unknown function DUF204  29.44 
 
 
187 aa  62.4  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0005  hypothetical protein  26.7 
 
 
197 aa  62  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.33307  hitchhiker  0.000135585 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1420  hypothetical protein  27.93 
 
 
198 aa  62  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000356412  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2039  hypothetical protein  29.21 
 
 
185 aa  62  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0180  hypothetical protein  27.16 
 
 
187 aa  61.2  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0169  hypothetical protein  27.54 
 
 
196 aa  61.2  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0582561  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1192  hypothetical protein  28.32 
 
 
194 aa  61.2  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0006  hypothetical protein  24.74 
 
 
195 aa  60.5  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000857448  hitchhiker  0.000000941545 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02753  membrane protein YebN  29.55 
 
 
232 aa  60.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1449  protein of unknown function DUF204  29.28 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.290539  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1725  membrane protein  28.82 
 
 
181 aa  58.9  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1637  hypothetical protein  25.43 
 
 
190 aa  58.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000104558  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0516  hypothetical protein  27.13 
 
 
213 aa  57.8  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1107  protein of unknown function DUF204  27.27 
 
 
192 aa  57.8  0.00000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26450  hypothetical protein  27.22 
 
 
189 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0067592  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7389  hypothetical protein  27.43 
 
 
185 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2372  hypothetical protein  27.16 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000118461  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1655  hypothetical protein  27.16 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000365012  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2468  hypothetical protein  27.16 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00922383  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21610  predicted membrane protein  31.02 
 
 
188 aa  57  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.890881  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2698  hypothetical protein  27.37 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0412  hypothetical protein  31.32 
 
 
184 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0503  hypothetical protein  26.06 
 
 
213 aa  55.8  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1800  cell division protein  26.16 
 
 
185 aa  54.7  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.145109  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4533  hypothetical protein  30 
 
 
188 aa  54.3  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0109117 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0007  hypothetical protein  26.94 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0975512  hitchhiker  0.00984847 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02600  predicted membrane protein  28.97 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000087208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>