More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3415 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03616  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.02 
 
 		 460 aa  637    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4235  ATP synthase F1, beta subunit  68.02 
 
 		 460 aa  637    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0564  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 		 464 aa  634    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.257197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.6 
 
 		 470 aa  673    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.24 
 
 		 470 aa  781    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.82 
 
 		 470 aa  780    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.73 
 
 		 470 aa  674    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0203  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.85 
 
 		 475 aa  649    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.838406  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3317  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.23 
 
 		 467 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.0243325 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  87.21 
 
 		 468 aa  833    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.31 
 
 		 465 aa  642    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.72 
 
 		 468 aa  729    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3968  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 464 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.24 
 
 		 463 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.52 
 
 		 484 aa  646    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  87.42 
 
 		 469 aa  838    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  87.42 
 
 		 469 aa  838    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.81 
 
 		 517 aa  639    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  87.42 
 
 		 469 aa  838    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2957  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 464 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.89 
 
 		 464 aa  673    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3355  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 464 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  68.52 
 
 		 547 aa  641    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.91 
 
 		 481 aa  661    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  69.13 
 
 		 482 aa  660    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4114  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.23 
 
 		 466 aa  644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.181857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.73 
 
 		 472 aa  653    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4042  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 464 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3346  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 467 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.185597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3015  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 464 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676639  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2797  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.44 
 
 		 459 aa  640    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.59 
 
 		 476 aa  662    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.34 
 
 		 482 aa  662    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0179  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 464 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54754  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.66 
 
 		 458 aa  646    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1587  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.16 
 
 		 459 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.986893  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.41 
 
 		 475 aa  647    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.15 
 
 		 468 aa  676    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.15 
 
 		 468 aa  675    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3288  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 		 464 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.44 
 
 		 482 aa  651    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.21 
 
 		 480 aa  664    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.3 
 
 		 462 aa  657    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  71.4 
 
 		 503 aa  654    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.6 
 
 		 470 aa  673    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.06 
 
 		 470 aa  666    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.59 
 
 		 458 aa  635    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  87.42 
 
 		 469 aa  838    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  87.63 
 
 		 464 aa  835    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.41 
 
 		 475 aa  647    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2315  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.96 
 
 		 484 aa  636    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.924902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0310  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.02 
 
 		 459 aa  636    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.239632  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.18 
 
 		 476 aa  653    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.96 
 
 		 474 aa  650    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.2 
 
 		 462 aa  707    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3308  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 464 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659546  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.74 
 
 		 465 aa  642    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.54 
 
 		 470 aa  659    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.17 
 
 		 476 aa  654    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.57 
 
 		 481 aa  665    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0026  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 		 466 aa  649    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122802  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.86 
 
 		 474 aa  635    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.96 
 
 		 476 aa  651    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2744  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.87 
 
 		 465 aa  650    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.885602  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0040  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.16 
 
 		 464 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0581071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.88 
 
 		 463 aa  640    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.17 
 
 		 476 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.83 
 
 		 475 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.17 
 
 		 476 aa  654    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0623  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.7 
 
 		 484 aa  646    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3494  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.02 
 
 		 467 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000137861  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 		 474 aa  639    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.34 
 
 		 513 aa  659    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2949  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 464 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.87 
 
 		 462 aa  651    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.17 
 
 		 519 aa  652    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.75 
 
 		 465 aa  685    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.75 
 
 		 465 aa  686    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4132  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 		 460 aa  636    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.364679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.45 
 
 		 509 aa  649    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.24 
 
 		 463 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.24 
 
 		 463 aa  635    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.24 
 
 		 470 aa  781    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.53 
 
 		 475 aa  720    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.42 
 
 		 476 aa  672    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2802  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.2 
 
 		 479 aa  642    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0097  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 		 464 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.26731  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.31 
 
 		 465 aa  642    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.19 
 
 		 469 aa  753    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.74 
 
 		 504 aa  725    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.06 
 
 		 480 aa  722    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.02 
 
 		 466 aa  729    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.96 
 
 		 468 aa  761    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 464 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.02 
 
 		 469 aa  649    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3458  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.65 
 
 		 474 aa  639    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.45 
 
 		 463 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.145707 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1181  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.87 
 
 		 468 aa  637    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.186447  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.88 
 
 		 465 aa  640    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.82 
 
 		 471 aa  672    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>