More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3341 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  100 
 
 
409 aa  830    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  73.59 
 
 
409 aa  627  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  62.01 
 
 
425 aa  499  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  57.88 
 
 
409 aa  490  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.2 
 
 
415 aa  327  3e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.88 
 
 
412 aa  305  9.000000000000001e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  43.31 
 
 
431 aa  300  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.9 
 
 
447 aa  294  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  37.96 
 
 
411 aa  293  3e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  40 
 
 
408 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  41.83 
 
 
415 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  42.09 
 
 
433 aa  290  4e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  40.05 
 
 
412 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  40.2 
 
 
415 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  40.1 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  41.99 
 
 
415 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  39.41 
 
 
417 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  41.65 
 
 
415 aa  282  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  40.69 
 
 
591 aa  282  9e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  39.2 
 
 
411 aa  281  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  40.44 
 
 
425 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  39.8 
 
 
426 aa  279  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  37.37 
 
 
415 aa  279  8e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  40.1 
 
 
416 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  40.98 
 
 
423 aa  277  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  39.74 
 
 
427 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  40.88 
 
 
414 aa  276  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  38.19 
 
 
418 aa  275  8e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  39.81 
 
 
414 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  39.74 
 
 
427 aa  275  9e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  39.45 
 
 
427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  38.96 
 
 
411 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7482  allantoate amidohydrolase  40.2 
 
 
431 aa  274  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0271426  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  39.01 
 
 
413 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.93 
 
 
413 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  39.32 
 
 
418 aa  272  8.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  41.73 
 
 
417 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  42.54 
 
 
417 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.97 
 
 
424 aa  271  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  38.82 
 
 
420 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  40.93 
 
 
414 aa  269  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  39.13 
 
 
421 aa  270  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.46 
 
 
421 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  38.37 
 
 
428 aa  268  1e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  37.99 
 
 
591 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  38.66 
 
 
430 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  41.69 
 
 
418 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.69 
 
 
412 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  37.14 
 
 
430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  40.39 
 
 
423 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  39.07 
 
 
422 aa  266  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  38.61 
 
 
429 aa  266  5e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  39.36 
 
 
593 aa  266  5e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  37.44 
 
 
406 aa  266  5.999999999999999e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  36.36 
 
 
423 aa  266  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  38.77 
 
 
412 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  38.33 
 
 
416 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4148  amidase  38.14 
 
 
421 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  39.85 
 
 
424 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  40.1 
 
 
427 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  37.32 
 
 
429 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  38.29 
 
 
422 aa  263  6e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  40.54 
 
 
423 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  41.63 
 
 
479 aa  262  8e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  40.39 
 
 
419 aa  262  8.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  38.94 
 
 
442 aa  262  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  37.59 
 
 
426 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  37.35 
 
 
426 aa  260  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  38.48 
 
 
427 aa  259  6e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  39.6 
 
 
427 aa  259  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  39.85 
 
 
425 aa  258  9e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  39.85 
 
 
425 aa  258  9e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.63 
 
 
428 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  39.24 
 
 
421 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42.67 
 
 
407 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  37.9 
 
 
431 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  39.3 
 
 
420 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  38.29 
 
 
415 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  40.2 
 
 
423 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  38.63 
 
 
599 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  38.48 
 
 
427 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  39.22 
 
 
426 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  39.22 
 
 
426 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  38.44 
 
 
420 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  39.36 
 
 
427 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.03 
 
 
407 aa  257  3e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  36.48 
 
 
408 aa  256  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  39.85 
 
 
423 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  41.11 
 
 
418 aa  256  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  38.37 
 
 
594 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  38.35 
 
 
427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  36.67 
 
 
416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  41.27 
 
 
424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  36.76 
 
 
416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  39.2 
 
 
416 aa  253  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  39.13 
 
 
592 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  37.47 
 
 
426 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  36.67 
 
 
425 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  39.12 
 
 
427 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.71 
 
 
420 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>