More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3330 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  100 
 
 		 497 aa  1002    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  59.47 
 
 		 494 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  59.47 
 
 		 494 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  59.47 
 
 		 494 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  58.86 
 
 		 494 aa  598  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  59.06 
 
 		 494 aa  600  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  59.06 
 
 		 494 aa  599  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  58.18 
 
 		 496 aa  595  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  58.86 
 
 		 494 aa  596  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  58.38 
 
 		 496 aa  596  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  58.66 
 
 		 494 aa  592  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0667  ribose ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 461 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  51.41 
 
 		 496 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  52.55 
 
 		 492 aa  513  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  50.71 
 
 		 492 aa  501  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  50.3 
 
 		 495 aa  504  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  51.11 
 
 		 501 aa  502  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  50.91 
 
 		 505 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  50 
 
 		 503 aa  502  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  50.71 
 
 		 501 aa  498  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  50.6 
 
 		 513 aa  498  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  50.1 
 
 		 501 aa  491  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  50.3 
 
 		 501 aa  494  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  50.1 
 
 		 494 aa  494  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.29 
 
 		 525 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 501 aa  490  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  49.9 
 
 		 501 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  49.08 
 
 		 525 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  50.71 
 
 		 504 aa  488  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  48.89 
 
 		 501 aa  486  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  50.91 
 
 		 500 aa  487  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  50.1 
 
 		 500 aa  482  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  49.49 
 
 		 501 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  49.49 
 
 		 507 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  49.49 
 
 		 501 aa  482  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  49.49 
 
 		 501 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  49.49 
 
 		 501 aa  483  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  49.49 
 
 		 501 aa  482  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  49.7 
 
 		 507 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  49.49 
 
 		 501 aa  482  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  49.49 
 
 		 507 aa  481  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  49.29 
 
 		 516 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  47.78 
 
 		 524 aa  481  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  50.2 
 
 		 501 aa  481  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  49.29 
 
 		 516 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  49.08 
 
 		 524 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  49.08 
 
 		 524 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  49.7 
 
 		 499 aa  479  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  49.29 
 
 		 501 aa  480  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  49.08 
 
 		 524 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  49.49 
 
 		 506 aa  480  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  49.29 
 
 		 501 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  49.09 
 
 		 506 aa  479  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  49.29 
 
 		 501 aa  480  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  50 
 
 		 501 aa  480  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  49.29 
 
 		 501 aa  478  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  49.29 
 
 		 516 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  49.29 
 
 		 516 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  48.88 
 
 		 524 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.88 
 
 		 527 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  47.86 
 
 		 523 aa  475  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  49.08 
 
 		 524 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  49.7 
 
 		 514 aa  477  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  50.91 
 
 		 501 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  49.29 
 
 		 501 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  49.08 
 
 		 524 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  46.45 
 
 		 493 aa  474  1e-132  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  49.29 
 
 		 516 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  48.48 
 
 		 506 aa  475  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  47.17 
 
 		 515 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  49.08 
 
 		 495 aa  474  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  48.48 
 
 		 501 aa  473  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  48.07 
 
 		 516 aa  472  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 505 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  48.58 
 
 		 500 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  48.98 
 
 		 513 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  49.39 
 
 		 494 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  46.96 
 
 		 495 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  46.77 
 
 		 517 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  47.41 
 
 		 505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  49.8 
 
 		 503 aa  471  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  47.17 
 
 		 520 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  49.49 
 
 		 513 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  48.89 
 
 		 514 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  47.76 
 
 		 512 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  47.14 
 
 		 494 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  48.98 
 
 		 513 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  49.6 
 
 		 512 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  48.28 
 
 		 498 aa  468  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  48.37 
 
 		 500 aa  468  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  47.25 
 
 		 515 aa  462  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  48.88 
 
 		 514 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  45.84 
 
 		 503 aa  462  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  46.75 
 
 		 509 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  48.88 
 
 		 514 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  47.67 
 
 		 496 aa  462  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  47.44 
 
 		 513 aa  462  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4063  xylose transporter ATP-binding subunit  47.62 
 
 		 513 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  48.48 
 
 		 513 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0147  xylose transporter ATP-binding subunit  47.62 
 
 		 513 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>